RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588555.1

SCAMP4-210, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

Gene SCAMP4, Length 1,785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-210ENST00000588555 STK17BO94768 372 aa24.16■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 AK1P00568 194 aa24.16■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 FESP07332 822 aa24.16■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 CYC1P08574 325 aa24.16■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 FTH1P19P0C7X4 201 aa24.16■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 CT45A8P0DMV1 189 aa24.16■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 CT45A9P0DMV2 189 aa24.16■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC5A2P31639 672 aa24.16■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 EMP2P54851 167 aa24.16■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 HPCAP84074 193 aa24.16■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 CT45A2Q5DJT8 189 aa24.16■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 AP1ARQ63HQ0 302 aa24.16■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 ASCL5Q7RTU5 278 aa24.16■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 SPPL2AQ8TCT8 520 aa24.16■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 EME1Q96AY2 570 aa24.16■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa24.16■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 ITPAQ9BY32 194 aa24.16■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 SPRY4Q9C004 299 aa24.16■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 SAP130Q9H0E3 1048 aa24.16■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 PRODH2Q9UF12 536 aa24.16■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 MKLN1Q9UL63 735 aa24.16■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 WDR45Q9Y484 360 aa24.16■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa24.15■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 OR1E2P47887 323 aa24.15■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP24.15■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 HMGN2P46Q86SG4 172 aa24.15■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa24.15■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC46A1Q96NT5 459 aa24.15■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 NUDT9Q9BW91 350 aa24.15■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 FBXO34Q9NWN3 711 aa24.15■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 OAZ3Q9UMX2 235 aa24.15■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 DTNAQ9Y4J8 743 aa24.15■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 SAC3D1A6NKF1 404 aa24.14■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 C9orf172C9J069 976 aa24.14■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 KCNK2O95069 426 aa24.14■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 DLGAP3O95886 979 aa24.14■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 SFT2D3Q587I9 215 aa24.14■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 TMEM205Q6UW68 189 aa24.14■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 IZUMO2Q6UXV1 221 aa24.14■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 COMTD1Q86VU5 262 aa24.14■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 CATSPER1Q8NEC5 780 aa24.14■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 VPS50Q96JG6 964 aa24.14■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 ART5Q96L15 291 aa24.14■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 BTBD9Q96Q07 612 aa24.14■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 CRB3Q9BUF7 120 aa24.14■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 THSD1Q9NS62 852 aa24.14■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 NDUFAF4Q9P032 175 aa24.14■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 SH3GLB1Q9Y371 365 aa24.14■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 TTC36A6NLP5 189 aa24.14■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 ACOX3O15254 700 aa24.14■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 STX11O75558 287 aa24.14■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 EPPINO95925 133 aa24.14■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 GPR143P51810 404 aa24.14■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 NCF4Q15080 339 aa24.14■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 MORN4Q8NDC4 146 aa24.14■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 OR4N2Q8NGD1 307 aa24.14■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 OR1N1Q8NGS0 311 aa24.14■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 TMBIM1Q969X1 311 aa24.14■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF354BQ96LW1 612 aa24.14■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 COQ10BQ9H8M1 238 aa24.14■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 KNTC1P50748 2209 aa24.13■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa24.13■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 DIRAS1O95057 198 aa24.13■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 ALPPP05187 535 aa24.13■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 FIGNL1Q6PIW4 674 aa24.13■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 METTL21AQ8WXB1 218 aa24.13■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC29A1Q99808 456 aa24.13■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 VNN3Q9NY84 501 aa24.13■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 C9J4A7 227 aa24.12■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 KIAA0513O60268 411 aa24.12■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 BRINP1O60477 761 aa24.12■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 GUSBP08236 651 aa24.12■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 OR2T5Q6IEZ7 315 aa24.12■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 OR2T29Q8NH02 315 aa24.12■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 PROX1Q92786 737 aa24.12■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 PINK1Q9BXM7 581 aa24.12■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa24.12■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 Q9N2J8 555 aa24.12■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 POLE3Q9NRF9 147 aa24.12■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 CFL2Q9Y281 166 aa24.12■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 LRRC42Q9Y546 428 aa24.12■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 AK5Q9Y6K8 562 aa24.12■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 SOCS2O14508 198 aa24.11■■□□□ 1.45
SCAMP4-210ENST00000588555 TM4SF5O14894 197 aa24.11■■□□□ 1.45
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