RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 BCL2L10Q9HD36 194 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 SLC6A13Q9NSD5 602 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 ASF1BQ9NVP2 202 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 FKBP14Q9NWM8 211 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 NDOR1Q9UHB4 597 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 MKLN1Q9UL63 735 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 USP22Q9UPT9 525 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 CA5BQ9Y2D0 317 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 U3KQV3 271 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 A0A0U1RQS6 177 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 A0A1W2PRQ8 180 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 OR2A25A4D2G3 310 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 URADA6NGE7 173 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 DUXAA6NLW8 204 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 D6RAR5 112 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 PTGES3LE9PB15 166 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 hCG_2039718K7EN88 272 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 SYT5O00445 386 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 PRAMEF4O60810 478 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 MTX2O75431 263 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 SNX4O95219 450 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 CDK1P06493 297 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 OCM2P0CE71 109 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 MATN1P21941 496 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 PSMB9P28065 219 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 LIMS1P48059 325 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 ENTPD1P49961 510 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 MVDP53602 400 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 UGT2B15P54855 530 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 MANFP55145 182 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 DEFA1P59665 94 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 DEFA3P59666 94 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 PPP2CBP62714 309 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 PPP2CAP67775 309 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 CDK3Q00526 305 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 RELAQ04206 551 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 TLE4Q04727 773 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 GAB1Q13480 694 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 TP53BP2Q13625 1128 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 DGCR6Q14129 220 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 FGL2Q14314 439 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 NR1D2Q14995 579 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 ZSWIM7Q19AV6 140 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 ZNF181Q2M3W8 571 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 TRIM16LQ309B1 348 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 SPDYE7PQ495Y7 208 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 IQCCQ4KMZ1 466 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 CLECL1Q8IZS7 167 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 LGI4Q8N135 537 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 SLC43A2Q8N370 569 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 STX19Q8N4C7 294 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 DNAJC22Q8N4W6 341 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 IL22RA1Q8N6P7 574 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 ZNF366Q8N895 744 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 C7orf57Q8NEG2 295 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 GPR156Q8NFN8 814 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 OR4C15Q8NGM1 316 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 OR8J1Q8NGP2 316 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 OR2L8Q8NGY9 312 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 SUN3Q8TAQ9 357 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 FAM110BQ8TC76 370 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 GPBAR1Q8TDU6 330 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 ZFPM2Q8WW38 1151 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 DHRS1Q96LJ7 313 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 ZNF354BQ96LW1 612 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 COQ7Q99807 217 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 CCDC3Q9BQI4 270 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 DGCR6LQ9BY27 220 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 SP140LQ9H930 580 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 TMEM184CQ9NVA4 438 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 SNX7Q9UNH6 387 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 PEX16Q9Y5Y5 336 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 WNK1Q9H4A3 2382 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 A0A0G2JK05 382 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 A0A0G2JPF8 293 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 A0A1W2PQM1 296 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 EFCAB9A8MZ26 197 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 NDUFS4O43181 175 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 LATO43561 262 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 UGT2B17O75795 530 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-218ENST00000584243 MED26O95402 600 aa7.54□□□□□ -1.2
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