RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-231ENST00000552222 STT3AP46977 705 aa12.66□□□□□ -0.38
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CS-231ENST00000552222 PLIN5Q00G26 463 aa12.66□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 PDE7AQ13946 482 aa12.66□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 PRSS53Q2L4Q9 553 aa12.66□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 ZNF750Q32MQ0 723 aa12.66□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa12.66□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 C1orf185Q5T7R7 199 aa12.66□□□□□ -0.38
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CS-231ENST00000552222 OR2M7Q8NG81 312 aa12.66□□□□□ -0.38
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CS-231ENST00000552222 KLHL29Q96CT2 875 aa12.66□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
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CS-231ENST00000552222 SIKE1Q9BRV8 207 aa12.66□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 TTTY12Q9BZ98 90 aa12.66□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 REEP4Q9H6H4 257 aa12.66□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa12.66□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 NPHS2Q9NP85 383 aa12.66□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 MIEF1Q9NQG6 463 aa12.66□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa12.66□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 ACAD8Q9UKU7 415 aa12.66□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 HIVEP2P31629 2446 aa12.66□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 WIPF1O43516 503 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 ITGA10O75578 1167 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 IFNA16P05015 189 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 CPMP14384 443 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 PCSK2P16519 638 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 PRPS1L1P21108 318 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 HPCAL1P37235 193 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 FEN1P39748 380 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 CLDN8P56748 225 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 C21orf58P58505 322 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 CGB2Q6NT52 195 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 FAM180BQ6P0A1 224 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 POMZP3Q6PJE2 187 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 TRILQ7L0X0 811 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 P3H2Q8IVL5 708 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 TMEM156Q8N614 296 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 OR14A16Q8NHC5 309 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 RFWD2Q8NHY2 731 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 MTERF3Q96E29 417 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 EBF4Q9BQW3 602 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 CCDC28BQ9BUN5 200 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 DEFB126Q9BYW3 111 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 TCF7L2Q9NQB0 619 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 AIG1Q9NVV5 245 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 ATP6V1HQ9UI12 483 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 EDARQ9UNE0 448 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 GPR45Q9Y5Y3 372 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 MXRA5Q9NR99 2828 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-231ENST00000552222 FIGNL2A6NMB9 653 aa12.64□□□□□ -0.39
CS-231ENST00000552222 CLCA1A8K7I4 914 aa12.64□□□□□ -0.39
CS-231ENST00000552222 FAM171A2A8MVW0 826 aa12.64□□□□□ -0.39
CS-231ENST00000552222 ANKRD28O15084 1053 aa12.64□□□□□ -0.39
CS-231ENST00000552222 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
CS-231ENST00000552222 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
CS-231ENST00000552222 OR10H2O60403 315 aa12.64□□□□□ -0.39
CS-231ENST00000552222 CRLF1O75462 422 aa12.64□□□□□ -0.39
CS-231ENST00000552222 OR6B1O95007 311 aa12.64□□□□□ -0.39
CS-231ENST00000552222 HRGP04196 525 aa12.64□□□□□ -0.39
CS-231ENST00000552222 ATP1B1P05026 303 aa12.64□□□□□ -0.39
CS-231ENST00000552222 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP12.64□□□□□ -0.39
CS-231ENST00000552222 COX7A2P14406 83 aa12.64□□□□□ -0.39
CS-231ENST00000552222 IDO1P14902 403 aa12.64□□□□□ -0.39
CS-231ENST00000552222 RPL3P39023 403 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
CS-231ENST00000552222 DNASE1L1P49184 302 aa12.64□□□□□ -0.39
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CS-231ENST00000552222 KRTAP1-1Q07627 177 aa12.64□□□□□ -0.39
CS-231ENST00000552222 SPRED3Q2MJR0 410 aa12.64□□□□□ -0.39
CS-231ENST00000552222 ZNF385BQ569K4 471 aa12.64□□□□□ -0.39
CS-231ENST00000552222 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa12.64□□□□□ -0.39
CS-231ENST00000552222 HMBOX1Q6NT76 420 aa12.64□□□□□ -0.39
CS-231ENST00000552222 IL20RBQ6UXL0 311 aa12.64□□□□□ -0.39
CS-231ENST00000552222 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
CS-231ENST00000552222 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
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