RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551253.5

CS-225, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 676 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-225ENST00000551253 TMEM52Q8NDY8 209 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 C7orf57Q8NEG2 295 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 PTCHD1Q96NR3 888 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 KCNA7Q96RP8 456 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 CSF3RQ99062 836 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 MECRQ9BV79 373 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 CENPHQ9H3R5 247 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 NECTIN3Q9NQS3 549 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 NMRK1Q9NWW6 199 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 PHF11Q9UIL8 331 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 SLC12A4Q9UP95 1085 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 TIMM22Q9Y584 194 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 CLDN16Q9Y5I7 305 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 GOLGA6L10A6NI86 522 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 ACOT7O00154 380 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 HS3ST1O14792 307 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 BIRC5O15392 142 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 TMPRSS11DO60235 418 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 NDUFS7O75251 213 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 EEDO75530 441 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 CRCPO75575 148 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 IL18BPO95998 194 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 FGF4P08620 206 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 FAM58BPP0C7Q3 252 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 UROSP10746 265 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 MAOAP21397 527 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 CTSSP25774 331 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 PPP2R1BP30154 601 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 CDKN1AP38936 164 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 SERPINB4P48594 390 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 ARFIP2P53365 341 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 SLC18A1P54219 525 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 HILS1P60008 231 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 PPIAP62937 165 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 LGALS3BPQ08380 585 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 SLC13A2Q13183 592 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 BIKQ13323 160 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP6.43□□□□□ -1.384e-6■■■□□ 18.9
CS-225ENST00000551253 TERF2Q15554 542 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 SGO1Q5FBB7 561 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 AGBL2Q5U5Z8 902 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 FAM219BQ5XKK7 198 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 KANK2Q63ZY3 851 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 LYPD8Q6UX82 237 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 GPR180Q86V85 440 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 FBXW8Q8N3Y1 598 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 OR6Y1Q8NGX8 325 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 TLCD1Q96CP7 247 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 PKNOX2Q96KN3 472 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 HS6ST2Q96MM7 605 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 HBEGFQ99075 208 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 DEFB126Q9BYW3 111 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 ACPTQ9BZG2 426 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 SLITRK2Q9H156 845 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 SIRT5Q9NXA8 310 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 KLHL28Q9NXS3 571 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 VPS29Q9UBQ0 182 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 FBXW2Q9UKT8 454 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 ATG4BQ9Y4P1 393 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 ASB4Q9Y574 426 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 POM121CA8CG34 1229 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 NPIPB8E9PQR5 432 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 AZIN1O14977 448 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 SSX4O60224 188 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 LDB3O75112 727 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 GUCY1B2O75343 617 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 AIFM1O95831 613 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 TGFAP01135 160 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 KLK1P06870 262 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 CHRNGP07510 517 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 FREM3P0C091 2139 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 NR2F6P10588 404 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 CHN1P15882 459 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 USF1P22415 310 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 PRPH2P23942 346 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 SERPINB3P29508 390 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-225ENST00000551253 MAN2A2P49641 1150 aa6.42□□□□□ -1.38
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