RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 COQ9O75208 318 aa10.48□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 GSNP06396 782 aa10.48□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 CD46P15529 392 aa10.48□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 CDKN2CP42773 168 aa10.48□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 CDK9P50750 372 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 LTB4RQ15722 352 aa10.48□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 C3AR1Q16581 482 aa10.48□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 ZSCAN26Q16670 478 aa10.48□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF628Q5EBL2 1059 aa10.48□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 SPINK14Q6IE38 97 aa10.48□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 H3F3CQ6NXT2 135 aa10.48□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 FAM111BQ6SJ93 734 aa10.48□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM107Q6UX40 140 aa10.48□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 DLEU7Q6UYE1 221 aa10.48□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 SLC5A8Q8N695 610 aa10.48□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 MDS2Q8NDY4 140 aa10.48□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 OR7G1Q8NGA0 311 aa10.48□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 M1APQ8TC57 530 aa10.48□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 CTHRC1Q96CG8 243 aa10.48□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 SLC35A5Q9BS91 424 aa10.48□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 CNPPD1Q9BV87 410 aa10.48□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 CXorf36Q9H7Y0 433 aa10.48□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 MMP25Q9NPA2 562 aa10.48□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 CHST11Q9NPF2 352 aa10.48□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 MAT2BQ9NZL9 334 aa10.48□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 NTMQ9P121 344 aa10.48□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 TINAGQ9UJW2 476 aa10.48□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 NPIPA1Q9UND3 350 aa10.48□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 CORO2BQ9UQ03 480 aa10.48□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 CFL2Q9Y281 166 aa10.48□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 DOCK10Q96BY6 2186 aa10.48□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 ITPR2Q14571 2701 aa10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 SAGE2PA6NJ88 616 aa10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 CLIC1O00299 241 aa10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 UPK1AO00322 258 aa10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 GYG2O15488 501 aa10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 SOX30O94993 753 aa10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 COX6B1P14854 86 aa10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 MC3RP41968 323 aa10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 MAGEA8P43361 318 aa10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 SMSP52788 366 aa10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 PRKAG1P54619 331 aa10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 PSME3P61289 254 aa10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 MGAT2Q10469 447 aa10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 FUT7Q11130 342 aa10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 TP53BP2Q13625 1128 aa10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 DNAL1Q4LDG9 190 aa10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 RUNDC3AQ59EK9 446 aa10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 NANOGP8Q6NSW7 305 aa10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 SZRD1Q7Z422 152 aa10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 GDF7Q7Z4P5 450 aa10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 C6orf120Q7Z4R8 191 aa10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 PGAM4Q8N0Y7 254 aa10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 OR2L13Q8N349 312 aa10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 HORMAD2Q8N7B1 307 aa10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM178AQ8NBL3 297 aa10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 NUP43Q8NFH3 380 aa10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 OR7G2Q8NG99 324 aa10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 OR8J3Q8NGG0 315 aa10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 ZFP90Q8TF47 636 aa10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 FBXL20Q96IG2 436 aa10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 GPR137Q96N19 417 aa10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 ANKRD27Q96NW4 1050 aa10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 OR8D2Q9GZM6 311 aa10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 CDCP1Q9H5V8 836 aa10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 NANOGQ9H9S0 305 aa10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 TPT1P8Q9HAU6 139 aa10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 VAPAQ9P0L0 249 aa10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 SLAMF8Q9P0V8 285 aa10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 COPS7AQ9UBW8 275 aa10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 PRODH2Q9UF12 536 aa10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 BCAP29Q9UHQ4 241 aa10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF639Q9UID6 485 aa10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 ERVK-11Q9UQG0 969 aa10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 ERVK-19Q9WJR5 959 aa10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 L3MBTL1Q9Y468 752 aa10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa10.47□□□□□ -0.73
UBE2B-208ENST00000511807 GMEB1Q9Y692 573 aa10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms