RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485019.1

RBM34-208, Transcript of RNA binding motif protein 34, human

TSL 3

Gene RBM34, Length 409 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM34-208	ENST00000485019	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	KCNJ2	P63252	427 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	PMP22	Q01453	160 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	PLGLB1	Q02325	96 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	KLF10	Q13118	480 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	EFR3A	Q14156	821 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	DESI1	Q6ICB0	168 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	OR5D16	Q8NGK9	328 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	SPPL2A	Q8TCT8	520 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	GTF2H4	Q92759	462 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	SNRNP40	Q96DI7	357 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	SLC35A4	Q96G79	324 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	OR7D2	Q96RA2	312 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	NODAL	Q96S42	347 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	EPN3	Q9H201	632 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	OR51I1	Q9H343	314 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	SERHL	Q9NQF3	203 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	GIN1	Q9NXP7	522 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	LEF1	Q9UJU2	399 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	CHCHD2	Q9Y6H1	151 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	CACNA1B	Q00975	2339 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	MGA	Q8IWI9	3026 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	MED13	Q9UHV7	2174 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	DUXA	A6NLW8	204 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	KRT75	O95678	551 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	IL33	O95760	270 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	CYP4B1	P13584	511 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	CD1E	P15812	388 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	MAP3K8	P41279	467 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	DNASE1L1	P49184	302 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	MAPRE2	Q15555	327 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	GTDC1	Q4AE62	458 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	PAGE3	Q5JUK9	113 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	TBCEL	Q5QJ74	424 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	SAXO2	Q658L1	398 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	TNFAIP8L2	Q6P589	184 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	GALNT10	Q86SR1	603 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	OR2M7	Q8NG81	312 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	PNPT1	Q8TCS8	783 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	GRHL3	Q8TE85	626 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	HGD	Q93099	445 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	NEURL3	Q96EH8	262 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	JSRP1	Q96MG2	331 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	SECISBP2	Q96T21	854 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	DOHH	Q9BU89	302 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	BTBD2	Q9BX70	525 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	SH2D2A	Q9NP31	389 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	DEPP	Q9NTK1	212 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	EXD2	Q9NVH0	621 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	CPAMD8	Q8IZJ3	1885 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RBM34-208	ENST00000485019	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.54
RBM34-208	ENST00000485019	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
RBM34-208	ENST00000485019		A0A096LPI6	279 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RBM34-208	ENST00000485019	ASPDH	A6ND91	283 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RBM34-208	ENST00000485019	KCNK2	O95069	426 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RBM34-208	ENST00000485019	AGR2	O95994	175 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RBM34-208	ENST00000485019	OR12D1	P0DN82	309 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RBM34-208	ENST00000485019	ATP6V1C1	P21283	382 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RBM34-208	ENST00000485019	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
RBM34-208	ENST00000485019	RFC3	P40938	356 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RBM34-208	ENST00000485019	CASP3	P42574	277 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RBM34-208	ENST00000485019	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
RBM34-208	ENST00000485019	KHK	P50053	298 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RBM34-208	ENST00000485019	ALDH6A1	Q02252	535 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
RBM34-208	ENST00000485019	TLE1	Q04724	770 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RBM34-208	ENST00000485019	MMEL1	Q495T6	779 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RBM34-208	ENST00000485019	DCST2	Q5T1A1	773 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RBM34-208	ENST00000485019	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RBM34-208	ENST00000485019	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RBM34-208	ENST00000485019	BICRAL	Q6AI39	1079 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RBM34-208	ENST00000485019	C16orf62	Q7Z3J2	963 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF605	Q86T29	641 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RBM34-208	ENST00000485019	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
RBM34-208	ENST00000485019	RNF130	Q86XS8	419 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RBM34-208	ENST00000485019	POGLUT1	Q8NBL1	392 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RBM34-208	ENST00000485019	ZFP90	Q8TF47	636 aa		11.7	□□□□□ -0.54

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