RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 POU4F3Q15319 338 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 CCDC153Q494R4 210 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 RAET1LQ5VY80 246 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 NPSR1Q6W5P4 371 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 SEM1Q6ZVN7 128 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 PLCZ1Q86YW0 608 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 MED12LQ86YW9 2145 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 DDIASQ8IXT1 998 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 GCNT2Q8N0V5 402 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 C17orf47Q8NEP4 570 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 OR5M1Q8NGP8 315 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 OR2W6PQ8NHA6 318 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 GPR151Q8TDV0 419 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 JADE3Q92613 823 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 HGDQ93099 445 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 WDYHV1Q96HA8 205 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 TUBA1CQ9BQE3 449 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 YIPF4Q9BSR8 244 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 UBQLN3Q9H347 655 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 DSN1Q9H410 356 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 SLC24A3Q9HC58 644 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 MED11Q9P086 117 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 SH3BP4Q9P0V3 963 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF639Q9UID6 485 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 FBXL2Q9UKC9 423 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 EMCNQ9ULC0 261 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 L3MBTL1Q9Y468 752 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 WIF1Q9Y5W5 379 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 OR6C70A6NIJ9 312 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 CLCA1A8K7I4 914 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 H3BML4 177 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 RGS14O43566 566 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 PLIN3O60664 434 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 COQ9O75208 318 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 SPAG7O75391 227 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 CT45A8P0DMV1 189 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 CT45A9P0DMV2 189 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 HK1P19367 917 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 CTSSP25774 331 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 GABRA3P34903 492 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 CRHR1P34998 444 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 OPRM1P35372 400 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 CLK3P49761 638 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF136P52737 540 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 RPL38P63173 70 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 SIRPAP78324 504 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 FOXF2Q12947 444 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 CEBPEQ15744 281 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 DECR1Q16698 335 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 PRSS53Q2L4Q9 553 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 CT45A2Q5DJT8 189 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 NOXRED1Q6NXP6 359 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 AAGABQ6PD74 315 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 FRMD7Q6ZUT3 714 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 MARCH3Q86UD3 253 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 EXOC3L1Q86VI1 746 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 KIF18BQ86Y91 864 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 C10orf107Q8IVU9 208 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 WDSUB1Q8N9V3 476 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 C9orf106Q8NAJ2 232 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF675Q8TD23 568 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 SLC9A6Q92581 669 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 CTHRC1Q96CG8 243 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 DTNBP1Q96EV8 351 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 TSSK3Q96PN8 268 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 FAM111AQ96PZ2 611 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 TM9SF2Q99805 663 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 PRDM14Q9GZV8 571 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 LIME1Q9H400 295 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 LRTM1Q9HBL6 345 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 Q9N2J8 555 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 FLRT3Q9NZU0 649 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 CBLCQ9ULV8 474 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-209ENST00000480420 AKAP6Q13023 2319 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 AKAP9Q99996 3911 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 GXYLT2A0PJZ3 443 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 SLC28A1O00337 649 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 SYT5O00445 386 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 CASKO14936 926 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 AZIN1O14977 448 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 PDPK1O15530 556 aa7.33□□□□□ -1.24
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