RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477334.1

RBM39-231, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 949 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-231	ENST00000477334	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	HERVK_113	P63132	956 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	ERVK-8	P63133	956 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	SNX1	Q13596	522 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	GAMT	Q14353	236 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	RAB35	Q15286	201 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	TOR1AIP1	Q5JTV8	583 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	UTF1	Q5T230	341 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	OLFM4	Q6UX06	510 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	LCA5	Q86VQ0	697 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	ERICH1	Q86X53	443 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	C11orf24	Q96F05	449 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	OR5M11	Q96RB7	305 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	CARD6	Q9BX69	1037 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	DEFB126	Q9BYW3	111 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	HPF1	Q9NWY4	346 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	DHRS7	Q9Y394	339 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	NDC80	O14777	642 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	CT45A10	P0DMU9	189 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	TSPAN8	P19075	237 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	IGFBP5	P24593	272 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	RABIF	P47224	123 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	OR1D4	P47884	311 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	ALDH3B2	P48448	385 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	SERTAD2	Q14140	314 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	TGIF1	Q15583	401 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	LDLRAP1	Q5SW96	308 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	FCGR1B	Q92637	280 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	CASD1	Q96PB1	797 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	KRT23	Q9C075	422 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	ATG10	Q9H0Y0	220 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	MIEF1	Q9NQG6	463 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF275	Q9NSD4	429 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	GHRL	Q9UBU3	117 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	B4GALT7	Q9UBV7	327 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	TTC26	A0AVF1	554 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	FRG2C	A6NGY1	282 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334		H0YL77	283 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	SSX5	O60225	188 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	SLC2A10	O95528	541 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	GUCA1C	O95843	209 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	TGFA	P01135	160 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	SDC1	P18827	310 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	IL10	P22301	178 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	PTPN6	P29350	595 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	ACVR1B	P36896	505 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	IGLV3-21	P80748	117 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	FUT7	Q11130	342 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	ZP4	Q12836	540 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	IL18R1	Q13478	541 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	ASAH1	Q13510	395 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	PDIA5	Q14554	519 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	INA	Q16352	499 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	LGSN	Q5TDP6	509 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	KDM8	Q8N371	416 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF525	Q8N782	197 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	RNF148	Q8N7C7	305 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	SAMD8	Q96LT4	415 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RBM39-231	ENST00000477334	UBE4B	O95155	1302 aa		3.12	□□□□□ -1.91

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