RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472398.5

TTC3-214, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 1 (best)

Gene TTC3, Length 2,305 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-214	ENST00000472398	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	RTL9	Q8NET4	1388 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	NID2	Q14112	1375 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	KCNE1B	A0A087WTH5	132 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	CPED1	A4D0V7	1026 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	PPIAL4D	F5H284	164 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398		M0QZ92	97 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	LEFTY2	O00292	366 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	SLC28A1	O00337	649 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	PDXK	O00764	312 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	CYP26A1	O43174	497 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	XRCC2	O43543	280 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	OR1F1	O43749	312 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	OR2J3	O76001	311 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	OR6A2	O95222	327 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	PRAMEF1	O95521	474 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	ERBB2	P04626	1255 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	FAM228B	P0C875	321 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	IFI30	P13284	250 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	CD36	P16671	472 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	BGN	P21810	368 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	SDHA	P31040	664 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	FMO4	P31512	558 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	THBS4	P35443	961 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	CDK9	P50750	372 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	GALK1	P51570	392 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	CCL11	P51671	97 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	ESRRG	P62508	458 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	DEFA6	Q01524	100 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	SEMG2	Q02383	582 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	HYAL1	Q12794	435 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	TAF13	Q15543	124 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	CARTPT	Q16568	116 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	GSTA3	Q16772	222 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	MST1L	Q2TV78	715 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	ACSM6	Q6P461	480 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	MOB3C	Q70IA8	216 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	TMEM126B	Q8IUX1	230 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	KLHDC8A	Q8IYD2	350 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	CSNK1A1L	Q8N752	337 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	RNF141	Q8WVD5	230 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	P2RX5	Q93086	422 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	SLC35C1	Q96A29	364 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	RNF170	Q96K19	258 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	TMEM56	Q96MV1	263 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	EGFL8	Q99944	293 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	RSG1	Q9BU20	258 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	MRI1	Q9BV20	369 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	ASPN	Q9BXN1	380 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	DUSP16	Q9BY84	665 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	C6orf50	Q9HD87	102 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	DYRK4	Q9NR20	520 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	SMOX	Q9NWM0	555 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	RHCG	Q9UBD6	479 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	COPS7A	Q9UBW8	275 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	PADI3	Q9ULW8	664 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	PSG11	Q9UQ72	335 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398		A0A1W2PQD8	194 aa		3	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398		M0QZK8	103 aa		3	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	CYB561D2	O14569	222 aa		3	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	SLC22A1	O15245	554 aa		3	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	AIRE	O43918	545 aa		3	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	SRPX2	O60687	465 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93

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