RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469251.1

RERE-211, Transcript of arginine-glutamic acid dipeptide repeats, humanhuman

TSL 3

Gene RERE, Length 355 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RERE-211ENST00000469251 KDELR3O43731 214 aa2.69□□□□□ -1.98
RERE-211ENST00000469251 CST8O60676 142 aa2.69□□□□□ -1.98
RERE-211ENST00000469251 SOCS5O75159 536 aa2.69□□□□□ -1.98
RERE-211ENST00000469251 NDUFS7O75251 213 aa2.69□□□□□ -1.98
RERE-211ENST00000469251 GOSR1O95249 250 aa2.69□□□□□ -1.98
RERE-211ENST00000469251 IFNB1P01574 187 aa2.69□□□□□ -1.98
RERE-211ENST00000469251 CD48P09326 243 aa2.69□□□□□ -1.98
RERE-211ENST00000469251 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa2.69□□□□□ -1.98
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RERE-211ENST00000469251 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
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RERE-211ENST00000469251 EFNB3Q15768 340 aa2.69□□□□□ -1.98
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RERE-211ENST00000469251 MFSD7Q6UXD7 560 aa2.69□□□□□ -1.98
RERE-211ENST00000469251 WASH2PQ6VEQ5 465 aa2.69□□□□□ -1.98
RERE-211ENST00000469251 TMEM26Q6ZUK4 368 aa2.69□□□□□ -1.98
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RERE-211ENST00000469251 GPR180Q86V85 440 aa2.69□□□□□ -1.98
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RERE-211ENST00000469251 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
RERE-211ENST00000469251 CCL4L1Q8NHW4 92 aa2.69□□□□□ -1.98
RERE-211ENST00000469251 GRHL3Q8TE85 626 aa2.69□□□□□ -1.98
RERE-211ENST00000469251 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
RERE-211ENST00000469251 NR4A3Q92570 626 aa2.69□□□□□ -1.98
RERE-211ENST00000469251 NUS1Q96E22 293 aa2.69□□□□□ -1.98
RERE-211ENST00000469251 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
RERE-211ENST00000469251 DTD2Q96FN9 168 aa2.69□□□□□ -1.98
RERE-211ENST00000469251 PGAM5Q96HS1 289 aa2.69□□□□□ -1.98
RERE-211ENST00000469251 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
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RERE-211ENST00000469251 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
RERE-211ENST00000469251 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa2.69□□□□□ -1.98
RERE-211ENST00000469251 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP2.69□□□□□ -1.989e-7■■■■□ 24.6
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RERE-211ENST00000469251 RAB6CQ9H0N0 254 aa2.69□□□□□ -1.98
RERE-211ENST00000469251 RAB17Q9H0T7 212 aa2.69□□□□□ -1.98
RERE-211ENST00000469251 CCDC68Q9H2F9 335 aa2.69□□□□□ -1.98
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RERE-211ENST00000469251 FANCEQ9HB96 536 aa2.69□□□□□ -1.98
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RERE-211ENST00000469251 HOMER3Q9NSC5 361 aa2.69□□□□□ -1.98
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RERE-211ENST00000469251 RSPH14Q9UHP6 348 aa2.69□□□□□ -1.98
RERE-211ENST00000469251 VDAC3Q9Y277 283 aa2.69□□□□□ -1.98
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RERE-211ENST00000469251 SNX10Q9Y5X0 201 aa2.69□□□□□ -1.98
RERE-211ENST00000469251 HEATR5AQ86XA9 2040 aa2.69□□□□□ -1.98
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