RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460806.1

BHLHE40-202, Transcript of basic helix-loop-helix family member e40, humanhuman

TSL 2

Gene BHLHE40, Length 396 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40-202ENST00000460806 PAQR8Q8TEZ7 354 aa6.4□□□□□ -1.38
BHLHE40-202ENST00000460806 C10orf82Q8WW14 230 aa6.4□□□□□ -1.38
BHLHE40-202ENST00000460806 HGDQ93099 445 aa6.4□□□□□ -1.38
BHLHE40-202ENST00000460806 MOAP1Q96BY2 351 aa6.4□□□□□ -1.38
BHLHE40-202ENST00000460806 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
BHLHE40-202ENST00000460806 CHMP6Q96FZ7 201 aa6.4□□□□□ -1.38
BHLHE40-202ENST00000460806 SLC35A4Q96G79 324 aa6.4□□□□□ -1.38
BHLHE40-202ENST00000460806 FRMD6Q96NE9 622 aa6.4□□□□□ -1.38
BHLHE40-202ENST00000460806 CCDC115Q96NT0 180 aa6.4□□□□□ -1.38
BHLHE40-202ENST00000460806 YIPF4Q9BSR8 244 aa6.4□□□□□ -1.38
BHLHE40-202ENST00000460806 PROK2Q9HC23 129 aa6.4□□□□□ -1.38
BHLHE40-202ENST00000460806 SERHLQ9NQF3 203 aa6.4□□□□□ -1.38
BHLHE40-202ENST00000460806 SACM1LQ9NTJ5 587 aa6.4□□□□□ -1.38
BHLHE40-202ENST00000460806 DEPPQ9NTK1 212 aa6.4□□□□□ -1.38
BHLHE40-202ENST00000460806 ASF1BQ9NVP2 202 aa6.4□□□□□ -1.38
BHLHE40-202ENST00000460806 GPATCH2Q9NW75 528 aa6.4□□□□□ -1.38
BHLHE40-202ENST00000460806 TMEM45AQ9NWC5 275 aa6.4□□□□□ -1.38
BHLHE40-202ENST00000460806 FAM53CQ9NYF3 392 aa6.4□□□□□ -1.38
BHLHE40-202ENST00000460806 KLHL14Q9P2G3 628 aa6.4□□□□□ -1.38
BHLHE40-202ENST00000460806 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
BHLHE40-202ENST00000460806 CBLCQ9ULV8 474 aa6.4□□□□□ -1.38
BHLHE40-202ENST00000460806 TRIM33Q9UPN9 1127 aa6.4□□□□□ -1.38
BHLHE40-202ENST00000460806 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
BHLHE40-202ENST00000460806 OR10H1Q9Y4A9 318 aa6.4□□□□□ -1.38
BHLHE40-202ENST00000460806 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
BHLHE40-202ENST00000460806 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 ESPL1Q14674 2120 aa6.4□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 PCNX3Q9H6A9 2034 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 CCDC154A6NI56 674 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 OR6C70A6NIJ9 312 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 UGT2B11O75310 529 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 IGKV1D-16P01601 117 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 CRYABP02511 175 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 C1QCP02747 245 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 P04436 131 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 GSNP06396 782 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 ALOX5P09917 674 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 CAPN3P20807 821 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 CNR1P21554 472 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 DRD4P21917 467 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 UQCRC2P22695 453 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 PIGAP37287 484 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 RFC3P40938 356 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 DNASE1L1P49184 302 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 MAN2A2P49641 1150 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 KCNK10P57789 538 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 RPS26P62854 115 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 GNGT1P63211 74 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 RPP38P78345 283 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 LRRC74AQ0VAA2 488 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 GTF3C1Q12789 2109 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 EFR3AQ14156 821 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 RCAN2Q14206 197 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 VPS26BQ4G0F5 336 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 CYP27C1Q4G0S4 372 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 AGKQ53H12 422 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 RNFT1Q5M7Z0 435 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 PRAMEF20Q5VT98 475 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 METTL21CQ5VZV1 264 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 SLC22A10Q63ZE4 541 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 SAXO2Q658L1 398 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 BICRALQ6AI39 1079 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 CDC73Q6P1J9 531 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 BHLHB9Q6PI77 547 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 SLC2A7Q6PXP3 512 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 FAM180AQ6UWF9 173 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 ZNF621Q6ZSS3 439 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 C6orf120Q7Z4R8 191 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 ZNF605Q86T29 641 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 FBXW8Q8N3Y1 598 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 BCORP1Q8N888 145 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 COX18Q8N8Q8 333 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 SLC16A11Q8NCK7 471 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 OR2M7Q8NG81 312 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 DNAJB8Q8NHS0 232 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 GRHL3Q8TE85 626 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 FAR1Q8WVX9 515 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 PIK3R3Q92569 461 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 SLC9A6Q92581 669 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 JADE3Q92613 823 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 DIO2Q92813 273 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 CDS1Q92903 461 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 VPS33AQ96AX1 596 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 MIB2Q96AX9 1013 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 SPDL1Q96EA4 605 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 SLC35G5Q96KT7 338 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 COL21A1Q96P44 957 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 OR7D2Q96RA2 312 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 PANX1Q96RD7 426 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 NODALQ96S42 347 aa6.39□□□□□ -1.39
BHLHE40-202ENST00000460806 ADOQ96SZ5 270 aa6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms