RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415055.2

PTPRK-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 5

Gene PTPRK, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-210	ENST00000415055	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	RNF144B	Q7Z419	303 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	GPAT4	Q86UL3	456 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	SIAH3	Q8IW03	269 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	RPRML	Q8N4K4	120 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	DDHD1	Q8NEL9	900 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	ZNF398	Q8TD17	642 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	TFG	Q92734	400 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	OTULIN	Q96BN8	352 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	ZNF354B	Q96LW1	612 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	DOCK7	Q96N67	2140 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	AGPAT1	Q99943	283 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	ATG10	Q9H0Y0	220 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	GAN	Q9H2C0	597 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	TFB2M	Q9H5Q4	396 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	KCNK13	Q9HB14	408 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	ASIC5	Q9NY37	505 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	FBXL17	Q9UF56	701 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	ASF1A	Q9Y294	204 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	ANK2	Q01484	3957 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	FREM1	Q5H8C1	2179 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	HYKK	A2RU49	373 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	OR2A25	A4D2G3	310 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	VSTM2B	A6NLU5	285 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	GABRR3	A8MPY1	467 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	FAM157A	C9JC47	383 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	NPIPA2	E9PIF3	369 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	NPIPA3	F8WFD2	350 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	CTDSP2	O14595	271 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	SMPD2	O60906	423 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	IFNA2	P01563	188 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	TPM2	P07951	284 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	SP1	P08047	785 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	ANXA5	P08758	320 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	CD48	P09326	243 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	CCDC175	P0C221	793 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	MYBL1	P10243	752 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	TFEB	P19484	476 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	DRD4	P21917	467 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	TACR3	P29371	465 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	SOX2	P48431	317 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	PTH2R	P49190	550 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	MFAP4	P55083	255 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	ZBTB17	Q13105	803 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	PTPRCAP	Q14761	206 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	KIR2DS3	Q14952	304 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	TAZ	Q16635	292 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	MEP1A	Q16819	746 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	BCL7A	Q4VC05	210 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	ODF2	Q5BJF6	829 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	SLC25A25	Q6KCM7	469 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	FIGLA	Q6QHK4	219 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	PAQR7	Q86WK9	346 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	MDS2	Q8NDY4	140 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	NEK11	Q8NG66	645 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	OR5M9	Q8NGP3	310 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	FAM162A	Q96A26	154 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	CABS1	Q96KC9	395 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	WDFY2	Q96P53	400 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	TSGA13	Q96PP4	275 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	TRIB3	Q96RU7	358 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	SECISBP2	Q96T21	854 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	TIMP4	Q99727	224 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	CHRNA10	Q9GZZ6	450 aa		4.19	□□□□□ -1.74

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