RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 BDP1A6H8Y1 2624 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 CTDSP2O14595 271 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 UBXN7O94888 489 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 KCNK2O95069 426 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 DLGAP3O95886 979 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 CERS1P27544 350 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 KIF18BQ86Y91 864 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 CLIP4Q8N3C7 705 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 IQCF1Q8N6M8 205 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 GIMAP5Q96F15 307 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 C16orf58Q96GQ5 468 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 SAP130Q9H0E3 1048 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 SPHK1Q9NYA1 384 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 PHF11Q9UIL8 331 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 NCOR1O75376 2440 aa22.27■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa22.27■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 SNPHO15079 494 aa22.27■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 DNTTP04053 509 aa22.27■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 RGS1Q08116 209 aa22.27■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 PLK5Q496M5 336 aa22.27■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa22.27■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 AMIGO1Q86WK6 493 aa22.27■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 PIGXQ8TBF5 258 aa22.27■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 HTRA1Q92743 480 aa22.27■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 OSTF1Q92882 214 aa22.27■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 SLC25A46Q96AG3 418 aa22.27■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 OR2M4Q96R27 311 aa22.27■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 YIPF4Q9BSR8 244 aa22.27■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 BARHL1Q9BZE3 327 aa22.27■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa22.27■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 SCML1Q9UN30 329 aa22.27■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 PIAS3Q9Y6X2 628 aa22.27■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 FAM170BA6NMN3 283 aa22.26■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 LATO43561 262 aa22.26■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 OR5F1O95221 314 aa22.26■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 FPR3P25089 353 aa22.26■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 OMPP47874 163 aa22.26■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 TJAP1Q5JTD0 557 aa22.26■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 GDPD3Q7L5L3 318 aa22.26■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 LAPTM4BQ86VI4 370 aa22.26■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 FAM181AQ8N9Y4 354 aa22.26■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 OR14C36Q8NHC7 312 aa22.26■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 RFKQ969G6 155 aa22.26■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 ERLEC1Q96DZ1 483 aa22.26■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 C10orf90Q96M02 699 aa22.26■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 GABRG3Q99928 467 aa22.26■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 KCNS3Q9BQ31 491 aa22.26■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 KLHL25Q9H0H3 589 aa22.26■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 KCNE3Q9Y6H6 103 aa22.26■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 ATG2BQ96BY7 2078 aa22.26■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 ETV5P41161 510 aa22.26■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 MC3RP41968 323 aa22.26■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 ETV1P50549 477 aa22.26■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 PSPHP78330 225 aa22.26■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 CHRNEQ04844 493 aa22.26■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 SELENBP1Q13228 472 aa22.26■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 CDC73Q6P1J9 531 aa22.26■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 HSDL2Q6YN16 418 aa22.26■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 RRM2BQ7LG56 351 aa22.26■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 C16orf62Q7Z3J2 963 aa22.26■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 KLK6Q92876 244 aa22.26■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 COQ7Q99807 217 aa22.26■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa22.26■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 CCNYL3P0C7X3 344 aa22.25■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 MTNR1AP48039 350 aa22.25■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 CD300CQ08708 224 aa22.25■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 FAM214AQ32MH5 1076 aa22.25■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa22.25■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 ZNF730Q6ZMV8 503 aa22.25■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 AKAP14Q86UN6 197 aa22.25■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 CACUL1Q86Y37 369 aa22.25■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 TM4SF19Q96DZ7 209 aa22.25■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 MS4A4EQ96PG1 132 aa22.25■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa22.25■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 IL20Q9NYY1 176 aa22.25■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 MUTYHQ9UIF7 546 aa22.25■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa22.25■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 PRSS38A1L453 326 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 ISM1B1AKI9 464 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 AP3D1O14617 1153 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 IFI6P09912 130 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 SMIM10L1P0DMW3 83 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 ADPRHP54922 357 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 RAB8AP61006 207 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 KIR2DS3Q14952 304 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 ZNF750Q32MQ0 723 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 DESI1Q6ICB0 168 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms