RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000363613.1

RNU6-1017P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1017, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1017P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1017P-201ENST00000363613 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 SLC35A4Q96G79 324 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 TPD52L3Q96J77 140 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 COL21A1Q96P44 957 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 YIPF4Q9BSR8 244 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 C9orf16Q9BUW7 83 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 CHID1Q9BWS9 393 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 IKZF5Q9H5V7 419 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 TOR4AQ9NXH8 423 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 SELENONQ9NZV5 590 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 DNAJB9Q9UBS3 223 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 CTSFQ9UBX1 484 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 CBLCQ9ULV8 474 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 ERVK-11Q9UQG0 969 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 ORC6Q9Y5N6 252 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 AK5Q9Y6K8 562 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 FRG2CA6NGY1 282 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 SCDO00767 359 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 AP3D1O14617 1153 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 TP53I11O14683 189 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 TM4SF5O14894 197 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 TO15178 435 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 CLOCKO15516 846 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 DPM1O60762 260 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 E2F6O75461 281 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 REM1O75628 298 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 PRKD3O94806 890 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 H6PDO95479 791 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 CST1P01037 141 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 RHCEP18577 417 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 ATP6V1B2P21281 511 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 S1PR1P21453 382 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 RRM2P31350 389 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 GCKP35557 465 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 DLSTP36957 453 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 PIGAP37287 484 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 ETV5P41161 510 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 MAN2A2P49641 1150 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 EMDP50402 254 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 PNLIPRP2P54317 469 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 RRADP55042 308 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 SLC37A1P57057 533 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 RPS26P62854 115 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 DUSP2Q05923 314 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 DUSP8Q13202 625 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 DNASE1L3Q13609 305 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 SYPL1Q16563 259 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 DUSP5Q16690 384 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 FLYWCH1Q4VC44 716 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 AP1ARQ63HQ0 302 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 FAAH2Q6GMR7 532 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 RRM2BQ7LG56 351 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 ZNF550Q7Z398 422 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 HIPK1Q86Z02 1210 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 ADGRG5Q8IZF4 528 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 SLC34A3Q8N130 599 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 SVOPLQ8N434 492 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 ZNF615Q8N8J6 731 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 SLC38A9Q8NBW4 561 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 SLC16A11Q8NCK7 471 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 OR5D16Q8NGK9 328 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 OR52P1PQ8NH57 321 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 C16orf52Q8NHV5 167 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 NUBPLQ8TB37 319 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 CDS1Q92903 461 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 TSLPQ969D9 159 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 MAL2Q969L2 176 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 EME1Q96AY2 570 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 TMCO6Q96DC7 493 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 NXPE2Q96DL1 559 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 GIMAP5Q96F15 307 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 NRBF2Q96F24 287 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 C16orf58Q96GQ5 468 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 HSH2DQ96JZ2 352 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 ZNF354BQ96LW1 612 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 VSTM2LQ96N03 204 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 BTBD9Q96Q07 612 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 SDF2Q99470 211 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1017P-201ENST00000363613 SPSB2Q99619 263 aa6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms