RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358813.4

CCL20-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 800 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-201ENST00000358813 SLC39A4Q6P5W5 647 aa5□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa5□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 ZNF720Q7Z2F6 126 aa5□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 CRYBG2Q8N1P7 616 aa5□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 PRSS35Q8N3Z0 413 aa5□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 OR52B4Q8NGK2 314 aa5□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 OR2T34Q8NGX1 318 aa5□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 SLC2A14Q8TDB8 520 aa5□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 SAP25Q8TEE9 199 aa5□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 SORCS1Q8WY21 1168 aa5□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 C16orf58Q96GQ5 468 aa5□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 PKMYT1Q99640 499 aa5□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 GPA33Q99795 319 aa5□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 CBWD1Q9BRT8 395 aa5□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 FICDQ9BVA6 458 aa5□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 ZNF416Q9BWM5 594 aa5□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 CALN1Q9BXU9 219 aa5□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa5□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 STRADBQ9C0K7 418 aa5□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 DPEP3Q9H4B8 488 aa5□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 PANK4Q9NVE7 773 aa5□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 MALT1Q9UDY8 824 aa5□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 DAPK2Q9UIK4 370 aa5□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 GGA2Q9UJY4 613 aa5□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 SMC3Q9UQE7 1217 aa5□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 STYXL1Q9Y6J8 313 aa5□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 MYO16Q9Y6X6 1858 aa5□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 HELZP42694 1942 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 DSPP15924 2871 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 GON4LQ3T8J9 2241 aa4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 MYH11P35749 1972 aa4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 A0A0G2JNG1 304 aa4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 NME2P1O60361 137 aa4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 WDR1O75083 606 aa4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 TSC22D2O75157 780 aa4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 SPAG6O75602 509 aa4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 CALCBP10092 127 aa4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 CCDC130P13994 396 aa4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 DGKAP23743 735 aa4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 ISL1P61371 349 aa4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 RPP38P78345 283 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 BNC1Q01954 994 aa4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 CHIT1Q13231 466 aa4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 MFAP5Q13361 173 aa4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 GTF2H2Q13888 395 aa4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 KIR2DS5Q14953 304 aa4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 CST6Q15828 149 aa4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 ACCSLQ4AC99 568 aa4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 PHLDA2Q53GA4 152 aa4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 LDLRAP1Q5SW96 308 aa4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 CCDC183Q5T5S1 534 aa4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 OR7E24Q6IFN5 339 aa4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 UGT3A1Q6NUS8 523 aa4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 TMEM26Q6ZUK4 368 aa4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 PRUNE1Q86TP1 453 aa4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 ACOT1Q86TX2 421 aa4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 TMEM139Q8IV31 216 aa4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 OR11H4Q8NGC9 324 aa4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 DPF1Q92782 380 aa4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 TANKQ92844 425 aa4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 CNDP1Q96KN2 507 aa4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 PCDHB18PQ96TA0 734 aa4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 NDNQ99608 321 aa4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 IL12RB2Q99665 862 aa4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 MAP3K3Q99759 626 aa4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 PIGQQ9BRB3 760 aa4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 SIRPDQ9H106 197 aa4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 RNF121Q9H920 327 aa4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 LRRC4Q9HBW1 653 aa4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 ACOXLQ9NUZ1 547 aa4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 TMEM30AQ9NV96 361 aa4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 SIX4Q9UIU6 781 aa4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 SATB2Q9UPW6 733 aa4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 ERVK-19Q9WJR5 959 aa4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 ENTPD4Q9Y227 616 aa4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 ZZEF1O43149 2961 aa4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 ANK1P16157 1881 aa4.98□□□□□ -1.61
CCL20-201ENST00000358813 AKAP13Q12802 2813 aa4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms