RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 MAFIPQ8WZ33 124 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 SAMD8Q96LT4 415 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 DMRT3Q9NQL9 472 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 C12orf71A8MTZ7 269 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 PRAMEF2O60811 474 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 SELENOVP59797 346 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 TTC9BQ8N6N2 239 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 SLC22A8Q8TCC7 542 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 HIF3AQ9Y2N7 669 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 BEND4Q6ZU67 534 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 PDZD9Q8IXQ8 264 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 MDGA1Q8NFP4 955 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 SERINC2Q96SA4 455 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 MYADML2A6NDP7 307 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 PRPS1P60891 318 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 FTMTQ8N4E7 242 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 CREB3L4Q8TEY5 395 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 ANTXRLA6NF34 631 aa20.02■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 BPNT1O95861 308 aa20.02■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 MFSD13AQ14CX5 517 aa20.02■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 OR5AK2Q8NH90 309 aa20.02■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 MFSD8Q8NHS3 518 aa20.02■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa20.02■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 MRI1Q9BV20 369 aa20.02■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 CTXN1P60606 82 aa20.02■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 CPOQ8IVL8 374 aa20.02■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 H3BUI4 141 aa20.02■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 M0R3H8 397 aa20.02■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 DNAJB6O75190 326 aa20.02■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 DIRAS3O95661 229 aa20.02■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 IFNA5P01569 189 aa20.02■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 ITGAMP11215 1152 aa20.02■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 GPR26Q8NDV2 337 aa20.02■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 NDNFQ8TB73 568 aa20.02■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 ASB15Q8WXK1 588 aa20.02■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 OR1F2PQ96R84 312 aa20.02■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 MYH6P13533 1939 aa20.02■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 CTSAP10619 480 aa20.02■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 GCAP28676 217 aa20.02■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 SHFQ7M4L6 423 aa20.02■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 ALG8Q9BVK2 526 aa20.02■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 GPR174Q9BXC1 333 aa20.02■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 NENFQ9UMX5 172 aa20.02■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 PITPNBP48739 271 aa20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 PER3P56645 1201 aa20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 TTLL10Q6ZVT0 673 aa20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 FAM217AQ8IXS0 508 aa20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM130Q8N3G9 435 aa20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 MPP7Q5T2T1 576 aa20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 GSG1LQ6UXU4 331 aa20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 ATOH8Q96SQ7 321 aa20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 ACPTQ9BZG2 426 aa20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 B4GALT7Q9UBV7 327 aa20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 ACVR1CQ8NER5 493 aa20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 IL23AQ9NPF7 189 aa20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 HRGP04196 525 aa20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 JMJD7P0C870 316 aa20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 OR5AR1Q8NGP9 310 aa20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 PEX11GQ96HA9 241 aa20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 PITX2Q99697 317 aa20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 C2orf42Q9NWW7 574 aa20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 C5AR2Q9P296 337 aa20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 RGCCQ9H4X1 137 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 CREBZFQ9NS37 354 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 ERVK-19Q9WJR5 959 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 ACTL7AQ9Y615 435 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 NAP1L6A6NFF2 107 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 KIAA0355O15063 1070 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 APOC3P02656 99 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 CYBAP13498 195 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 HTR2BP41595 481 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 CLLU1OSQ5K130 101 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD54Q6NXT1 300 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 RAB11FIP2Q7L804 512 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 PNPLA1Q8N8W4 532 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 STRADBQ9C0K7 418 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF850A8MQ14 1090 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 RAB40BQ12829 278 aa20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms