RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261333.10

ZNF397-201, Transcript of zinc finger protein 397, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF397, Length 1,419 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397-201ENST00000261333 E9PLN8 166 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 AQP7O14520 342 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 TBX19O60806 448 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 SLITRK5O94991 958 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 SNX4O95219 450 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 CYP4B1P13584 511 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 KRT20P35900 424 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 RPL14P50914 215 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 DIO3P55073 304 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 GAB1Q13480 694 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 GXYLT1Q4G148 440 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 OR5M10Q6IEU7 315 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 ZNF585AQ6P3V2 769 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 RPTNQ6XPR3 784 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 PIK3R3Q92569 461 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 SLC35A4Q96G79 324 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 TMEM41AQ96HV5 264 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 VKORC1Q9BQB6 163 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 ATP6V1HQ9UI12 483 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 ACAD8Q9UKU7 415 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 SLC6A5Q9Y345 797 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 A0A1B0GVC2 190 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 B4DXG7 233 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 SNPHO15079 494 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 SCO2O43819 266 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 KITP10721 976 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 PTPN6P29350 595 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 DCTP40126 519 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 EIPR1Q53HC9 387 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 TIGD3Q6B0B8 471 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 MTFR2Q6P444 385 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 NUP43Q8NFH3 380 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 OR1J4Q8NGS1 313 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 NTNG2Q96CW9 530 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 TMCO6Q96DC7 493 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 GIMAP5Q96F15 307 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 YIPF4Q9BSR8 244 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 PKDREJQ9NTG1 2253 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 HAO1Q9UJM8 370 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 CBLCQ9ULV8 474 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 WIF1Q9Y5W5 379 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 SNX8Q9Y5X2 465 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 CSMD1Q96PZ7 3565 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 SUSD5O60279 629 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 HCN1O60741 890 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 C6orf47O95873 294 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 IGKV1D-16P01601 117 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 ACP2P11117 423 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 PRPS2P11908 318 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 GABRA3P34903 492 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 EVI2BP34910 448 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 STX5Q13190 355 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 DCST1Q5T197 706 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 CPTPQ5TA50 214 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 SLC30A6Q6NXT4 461 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 RIMKLAQ8IXN7 391 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 WDSUB1Q8N9V3 476 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 NEIL3Q8TAT5 605 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 SLC9A6Q92581 669 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 MTERF3Q96E29 417 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 C16orf58Q96GQ5 468 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 MS4A4EQ96PG1 132 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 Q9N2J8 555 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 ALKBH4Q9NXW9 302 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 FBXL2Q9UKC9 423 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 FAM215AQ9Y5M1 114 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 CSMD2Q7Z408 3487 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 FBN2P35556 2912 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 A0A1W2PRB8 838 aa14.58□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 OR14I1A6ND48 311 aa14.58□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 BCKDKO14874 412 aa14.58□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 ABCB7O75027 752 aa14.58□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 SMSP52788 366 aa14.58□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 NUP107P57740 925 aa14.58□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 EMX2Q04743 252 aa14.58□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 EFR3AQ14156 821 aa14.58□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 PGS1Q32NB8 556 aa14.58□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 TTMPQ5BVD1 217 aa14.58□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 RTL6Q6ICC9 239 aa14.58□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 TMEM81Q6P7N7 255 aa14.58□□□□□ -0.07
ZNF397-201ENST00000261333 HOMEZQ8IX15 550 aa14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.7 ms