RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233336.6

TTL-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTL, Length 14,269 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTL-201ENST00000233336 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 OR4N4Q8N0Y3 316 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 OR5W2Q8NH69 310 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 PAQR8Q8TEZ7 354 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 MROQ9BYG7 248 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 RETREG1Q9H6L5 497 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 UFSP2Q9NUQ7 469 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 CLEC4EQ9ULY5 219 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 A0A1W2PRU2 124 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 MAOAP21397 527 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 RPS5P46782 204 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 CDK10Q15131 360 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 RGMBQ6NW40 437 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 GPR149Q86SP6 731 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 POC1BQ8TC44 478 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 MALSU1Q96EH3 234 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 TMEM19Q96HH6 336 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 SLC16A8O95907 504 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 NDUFS1P28331 727 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 OR52P1PQ8NH57 321 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 C19orf12Q9NSK7 152 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 ANKRD33BA6NCL7 494 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 PCSK6P29122 969 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 GABRA3P34903 492 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 DCAF4L2Q8NA75 395 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 OR4E2Q8NGC2 313 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 OR52E2Q8NGJ4 325 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 DCUN1D4Q92564 292 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 OR7A17O14581 309 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 HSPA12AO43301 675 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 GTDC1Q4AE62 458 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 CMKLR1Q99788 373 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 FUCA1P04066 466 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 M6PRP20645 277 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 NAGSQ8N159 534 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 ECHDC3Q96DC8 303 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 EMC8O43402 210 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 FPGSQ05932 587 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 ZNF789Q5FWF6 425 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 GPR139Q6DWJ6 353 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 IGSF8Q969P0 613 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 C3orf30Q96M34 536 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 C20orf27Q9GZN8 174 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 ACTL8Q9H568 366 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 RHPN2P1A8MT19 583 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 SERPINF1P36955 418 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 SELENOWP63302 87 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 LAX1Q8IWV1 398 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 PSD2Q9BQI7 771 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 KATNBL1Q9H079 304 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 GPATCH2Q9NW75 528 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 FEZF1A0PJY2 475 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 SMIM18P0DKX4 95 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 PRKAR1BP31321 381 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 NRROSQ86YC3 692 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 FAM86B1Q8N7N1 296 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 A8MVJ9 347 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 ACPPP15309 386 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 ETV3P41162 512 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 WNT7BP56706 349 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 TPGS2Q68CL5 300 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 OR52N2Q8NGI0 321 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 CRB3Q9BUF7 120 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 HAPLN2Q9GZV7 340 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 SERINC1Q9NRX5 453 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 EVA1BQ9NVM1 165 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 LRFN1Q9P244 771 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 DLSTP36957 453 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 HTR6P50406 440 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 SELPLGQ14242 412 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 MFFQ9GZY8 342 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 OCEL1Q9H607 264 aa9.68□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 CLDN24A6NM45 220 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 CASC3O15234 703 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 PRKCAP17252 672 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 OVCA2Q8WZ82 227 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 PKD1L3Q7Z443 1732 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 KIF26BQ2KJY2 2108 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 PTPN2P17706 415 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 DCST2Q5T1A1 773 aa9.67□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms