RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616768.4

MLH1-223, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2

Gene MLH1, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-223	ENST00000616768	KIF2B	Q8N4N8	673 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	SLC5A8	Q8N695	610 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF525	Q8N782	197 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	PLD5	Q8N7P1	536 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	TTC29	Q8NA56	475 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	NAT14	Q8WUY8	206 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	TBRG4	Q969Z0	631 aa	Known RBP eCLIP	4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	TTTY12	Q9BZ98	90 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	NOD2	Q9HC29	1040 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM51	Q9NW97	253 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	NCKAP5	O14513	1909 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768		A0A0J9YY10	115 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	LCE6A	A0A183	80 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768		A0A1B0GVC2	190 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	EPPIN	O95925	133 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	SLC4A1	P02730	911 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	TPM3	P06753	285 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	NUDT17	P0C025	328 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	GPR89B	P0CG08	455 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	TPSB2	P20231	275 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	KDELR1	P24390	212 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	OPRM1	P35372	400 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	SPINT3	P49223	89 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	THBS3	P49746	956 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	MAX	P61244	160 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	IL10RB	Q08334	325 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	GALNT2	Q10471	571 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	TPSAB1	Q15661	275 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	BOLA3	Q53S33	107 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	AMZ2	Q86W34	360 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	RPS19BP1	Q86WX3	136 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	LACC1	Q8IV20	430 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	CYP4Z2P	Q8N1L4	340 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	ACVR1C	Q8NER5	493 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	OR52E1	Q8NGJ3	308 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	KRT35	Q92764	455 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	NEUROG1	Q92886	237 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	GLYATL1	Q969I3	302 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	CCDC42	Q96M95	316 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	OR2A14	Q96R47	310 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	PANX2	Q96RD6	677 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	MGME1	Q9BQP7	344 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	HGH1	Q9BTY7	390 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	ESM1	Q9NQ30	184 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	SPHK1	Q9NYA1	384 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	IKZF3	Q9UKT9	509 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	HERC1	Q15751	4861 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	IGLV3-12	A0A075B6K2	115 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768		A0A0J9YYE9	177 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	C1orf232	A0A0U1RR37	186 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768		A0A1W2PQ67	120 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	OR2AG2	A6NM03	316 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	TRBC1	P01850	177 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	POLB	P06746	335 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	MMP2	P08253	660 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	DANCR	P0C864	163 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	MAG	P20916	626 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	PTN	P21246	168 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	TIMP3	P35625	211 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	CDKN2B	P42772	138 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	GSTM5	P46439	218 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	HLCS	P50747	726 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	TAS2R50	P59544	299 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	ZBTB17	Q13105	803 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	PRKG2	Q13237	762 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	AADACL2	Q6P093	401 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MLH1-223	ENST00000616768	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		4.34	□□□□□ -1.71

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