RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 DTNBP1Q96EV8 351 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC35A4Q96G79 324 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF681Q96N22 645 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 SFXN2Q96NB2 322 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 COL21A1Q96P44 957 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 BTBD9Q96Q07 612 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 LRRC1Q9BTT6 524 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 VPS11Q9H270 941 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 ELOVL6Q9H5J4 265 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 PCTPQ9UKL6 214 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 PSME2Q9UL46 239 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC12A4Q9UP95 1085 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 B4DXG7 233 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 H7C1Q1 480 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 ZIC3O60481 467 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 TSPAN2O60636 221 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 REM1O75628 298 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 RBP1P09455 135 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 CT45A8P0DMV1 189 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 CT45A9P0DMV2 189 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 CRYGSP22914 178 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 MC3RP41968 323 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 BCL2A1Q16548 175 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 CT45A2Q5DJT8 189 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF628Q5EBL2 1059 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 SGO1Q5FBB7 561 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 LETMD1Q6P1Q0 360 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 VWA1Q6PCB0 445 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 PRSS57Q6UWY2 283 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 P4HA3Q7Z4N8 544 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 MILR1Q7Z6M3 343 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 PRIMA1Q86XR5 153 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 OR4F6Q8NGB9 312 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF675Q8TD23 568 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 NUDT8Q8WV74 236 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 STARD4Q96DR4 205 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 Q96MF0 132 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 ADOQ96SZ5 270 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 FAIM2Q9BWQ8 316 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 RAB17Q9H0T7 212 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 BRF2Q9HAW0 419 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 KLHL28Q9NXS3 571 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF226Q9NYT6 803 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 XPR1Q9UBH6 696 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 DKKL1Q9UK85 242 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 TMCO1Q9UM00 188 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 DSCAMO60469 2012 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 HEATR5AQ86XA9 2040 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC22A20A6NK97 555 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 OTCP00480 354 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 PDYNP01213 254 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 RPS17P08708 135 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 FPR1P21462 350 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 GRK2P25098 689 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 DPP4P27487 766 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 IL12BP29460 328 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 CCKARP32238 428 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 CD79BP40259 229 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 MAGEA12P43365 314 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 ALDH9A1P49189 494 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 GAS1P54826 345 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 CORO7P57737 925 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 B3GALT5-AS1P59052 145 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 EFR3AQ14156 821 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 ACKR1Q16570 336 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 OR5M10Q6IEU7 315 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 OR2A2Q6IF42 318 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 NPSR1Q6W5P4 371 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 BTLAQ7Z6A9 289 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 SELENOMQ8WWX9 145 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 ERP27Q96DN0 273 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 PIK3IP1Q96FE7 263 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 PGM2Q96G03 612 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 VSTM2LQ96N03 204 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM111AQ96PZ2 611 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 CCL19Q99731 98 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 MED18Q9BUE0 208 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 BDH2Q9BUT1 245 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 ANKRA2Q9H9E1 313 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 UBTD1Q9HAC8 227 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 HEY2Q9UBP5 337 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 UTS2RQ9UKP6 389 aa9.31□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms