RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 ALDH9A1P49189 494 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 OR5M10Q6IEU7 315 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 MILR1Q7Z6M3 343 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC35A4Q96G79 324 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 COX4I2Q96KJ9 171 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 ADOQ96SZ5 270 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC1Q9BTT6 524 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 PYCARDQ9ULZ3 195 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 C17orf51A8MQB3 221 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 DEFB108AA8MXU0 73 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP6CO00743 305 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGEF9O43307 516 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 CTIFO43310 598 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 REM1O75628 298 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF628Q5EBL2 1059 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 LETMD1Q6P1Q0 360 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 SCIMPQ6UWF3 145 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 P3H2Q8IVL5 708 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 BTBD9Q96Q07 612 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 HBEGFQ99075 208 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 KLHL28Q9NXS3 571 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 DKKL1Q9UK85 242 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 PSME2Q9UL46 239 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-211ENST00000590874 MSTNO14793 375 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 TSPAN2O60636 221 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 SMPD2O60906 423 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 RPS17P08708 135 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 RBP1P09455 135 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 CT45A8P0DMV1 189 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 CT45A9P0DMV2 189 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 CORO7P57737 925 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 CT45A2Q5DJT8 189 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 VWA1Q6PCB0 445 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 TAOK1Q7L7X3 1001 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 SELENOMQ8WWX9 145 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 STARD4Q96DR4 205 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 PIP5K1AQ99755 562 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 FAIM2Q9BWQ8 316 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 HEY2Q9UBP5 337 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 TMCO1Q9UM00 188 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 ESYT3A0FGR9 886 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM171A2A8MVW0 826 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 H7C1Q1 480 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 ZIC3O60481 467 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 TSPAN8P19075 237 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 GRK2P25098 689 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 CCKARP32238 428 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 MAGEA12P43365 314 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 B3GALT5-AS1P59052 145 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 NPSR1Q6W5P4 371 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 P4HA3Q7Z4N8 544 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF675Q8TD23 568 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF138Q8WVD3 245 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 BRF2Q9HAW0 419 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 UTS2RQ9UKP6 389 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 FN1P02751 2386 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 ABCB7O75027 752 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 SMIM24O75264 130 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 DPP4P27487 766 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 GAS1P54826 345 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 CDH13P55290 713 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 PRIMA1Q86XR5 153 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC116Q8IYX3 515 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 OR9A2Q8NGT5 310 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 NUDT8Q8WV74 236 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 KAT2AQ92830 837 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 PIGTQ969N2 578 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 PIK3IP1Q96FE7 263 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 Q96MF0 132 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 PFDN4Q9NQP4 134 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 OTCP00480 354 aa23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 CTAGE8P0CG41 777 aa23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 CD79BP40259 229 aa23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 MC3RP41968 323 aa23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP23.17■■□□□ 1.38e-7■■□□□ 12.1
CAPNS1-211ENST00000590874 BTLAQ7Z6A9 289 aa23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 CTAGE4Q8IX94 777 aa23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 UBQLNLQ8IYU4 475 aa23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 VSTM2LQ96N03 204 aa23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM111AQ96PZ2 611 aa23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 ACSS3Q9H6R3 686 aa23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 UBTD1Q9HAC8 227 aa23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF225Q9UK10 706 aa23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 SNX6Q9UNH7 406 aa23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC22A20A6NK97 555 aa23.16■■□□□ 1.3
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