RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC2A12Q8TD20 617 aa28.86■■■□□ 2.21
CAPNS1-206ENST00000588815 PMM1Q92871 262 aa28.86■■■□□ 2.21
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC47A1Q96FL8 570 aa28.86■■■□□ 2.21
CAPNS1-206ENST00000588815 SEPHS2Q99611 448 aa28.86■■■□□ 2.21
CAPNS1-206ENST00000588815 COPS7AQ9UBW8 275 aa28.86■■■□□ 2.21
CAPNS1-206ENST00000588815 PADI2Q9Y2J8 665 aa28.86■■■□□ 2.21
CAPNS1-206ENST00000588815 A8MVJ9 347 aa28.85■■■□□ 2.21
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CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF682O95780 498 aa28.85■■■□□ 2.21
CAPNS1-206ENST00000588815 DDAH2O95865 285 aa28.85■■■□□ 2.21
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CAPNS1-206ENST00000588815 SLC37A1P57057 533 aa28.85■■■□□ 2.21
CAPNS1-206ENST00000588815 ENPP6Q6UWR7 440 aa28.85■■■□□ 2.21
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF111Q6ZNA4 994 aa28.85■■■□□ 2.21
CAPNS1-206ENST00000588815 COX18Q8N8Q8 333 aa28.85■■■□□ 2.21
CAPNS1-206ENST00000588815 ANKFN1Q8N957 763 aa28.85■■■□□ 2.21
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CAPNS1-206ENST00000588815 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa28.85■■■□□ 2.21
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CAPNS1-206ENST00000588815 AP1ARQ63HQ0 302 aa28.85■■■□□ 2.21
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
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CAPNS1-206ENST00000588815 ESX1Q8N693 406 aa28.85■■■□□ 2.21
CAPNS1-206ENST00000588815 GPR151Q8TDV0 419 aa28.85■■■□□ 2.21
CAPNS1-206ENST00000588815 OR8D2Q9GZM6 311 aa28.85■■■□□ 2.21
CAPNS1-206ENST00000588815 POLE3Q9NRF9 147 aa28.85■■■□□ 2.21
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CAPNS1-206ENST00000588815 CLPSP04118 112 aa28.84■■■□□ 2.21
CAPNS1-206ENST00000588815 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
CAPNS1-206ENST00000588815 PSG6Q00889 435 aa28.84■■■□□ 2.21
CAPNS1-206ENST00000588815 SFT2D3Q587I9 215 aa28.84■■■□□ 2.21
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CAPNS1-206ENST00000588815 OR2Y1Q8NGV0 311 aa28.84■■■□□ 2.21
CAPNS1-206ENST00000588815 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa28.84■■■□□ 2.21
CAPNS1-206ENST00000588815 TAMM41Q96BW9 452 aa28.84■■■□□ 2.21
CAPNS1-206ENST00000588815 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
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CAPNS1-206ENST00000588815 PMS2P1A4D2B8 440 aa28.83■■■□□ 2.21
CAPNS1-206ENST00000588815 SAGE2PA6NJ88 616 aa28.83■■■□□ 2.21
CAPNS1-206ENST00000588815 H6PDO95479 791 aa28.83■■■□□ 2.21
CAPNS1-206ENST00000588815 CHRM4P08173 479 aa28.83■■■□□ 2.21
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CAPNS1-206ENST00000588815 V9GYQ6 96 aa28.83■■■□□ 2.21
CAPNS1-206ENST00000588815 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa28.82■■■□□ 2.2
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CAPNS1-206ENST00000588815 GABRA3P34903 492 aa28.82■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
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CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF350Q9GZX5 532 aa28.81■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 SAP130Q9H0E3 1048 aa28.81■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
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CAPNS1-206ENST00000588815 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 SEMG1P04279 462 aa28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 FOLR3P41439 243 aa28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 PPICP45877 212 aa28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 PSPHP78330 225 aa28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 B3GNT7Q8NFL0 401 aa28.8■■■□□ 2.2
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