RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMEM92Q6UXU6 159 aa15.46■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa15.46■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 VRK2Q86Y07 508 aa15.46■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR2L13Q8N349 312 aa15.46■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR7G2Q8NG99 324 aa15.46■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZFPM2Q8WW38 1151 aa15.46■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DIO2Q92813 273 aa15.46■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC35A4Q96G79 324 aa15.46■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CDADC1Q9BWV3 514 aa15.46■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ACTR10Q9NZ32 417 aa15.46■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC13A4Q9UKG4 626 aa15.46■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DAPP1Q9UN19 280 aa15.46■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TAF4O00268 1085 aa15.45■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CSO75390 466 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IFNGR2P38484 337 aa15.45■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SMSP52788 366 aa15.45■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RELAQ04206 551 aa15.45■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ST3GAL3Q11203 375 aa15.45■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RUNX2Q13950 521 aa15.45■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FIGLAQ6QHK4 219 aa15.45■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MRGPREQ86SM8 312 aa15.45■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IQCF1Q8N6M8 205 aa15.45■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR4K14Q8NGD5 310 aa15.45■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa15.45■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZG16BQ96DA0 208 aa15.45■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MND1Q9BWT6 205 aa15.45■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RNF167Q9H6Y7 350 aa15.45■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CTPS2Q9NRF8 586 aa15.45■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 AGAP5A6NIR3 686 aa15.45■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C10orf142B7Z368 130 aa15.45■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 B3GALT2O43825 422 aa15.45■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 AKT2P31751 481 aa15.45■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PDX1P52945 283 aa15.45■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GPR18Q14330 331 aa15.45■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa15.45■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ACSM5Q6NUN0 579 aa15.45■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 USP53Q70EK8 1073 aa15.45■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KIF18BQ86Y91 864 aa15.45■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC34A3Q8N130 599 aa15.45■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NANOGP1Q8N7R0 232 aa15.45■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CAMKVQ8NCB2 501 aa15.45■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PROKR2Q8NFJ6 384 aa15.45■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HHATLQ9HCP6 504 aa15.45■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SEMA4GQ9NTN9 838 aa15.45■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KLHL28Q9NXS3 571 aa15.45■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa15.45■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC22A7Q9Y694 548 aa15.45■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FCMRO60667 390 aa15.44■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TGM1P22735 817 aa15.44■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IFNA8P32881 189 aa15.44■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RGS19P49795 217 aa15.44■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TSPAN31Q12999 210 aa15.44■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SPHARQ15513 63 aa15.44■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DEFB134Q4QY38 66 aa15.44■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SYT14P1Q58G82 188 aa15.44■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EOGTQ5NDL2 527 aa15.44■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PERM1Q5SV97 790 aa15.44■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FRRS1Q6ZNA5 592 aa15.44■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ABHD13Q7L211 337 aa15.44■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa15.44■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC16A11Q8NCK7 471 aa15.44■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR52P1PQ8NH57 321 aa15.44■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa15.44■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa15.44■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RSC1A1Q92681 617 aa15.44■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PTGFRNQ9P2B2 879 aa15.44■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CLEC2DQ9UHP7 191 aa15.44■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 XIRP2A4UGR9 3374 aa15.44■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 UNC80Q8N2C7 3258 aa15.44■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM221BA6H8Z2 402 aa15.43■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR6C74A6NCV1 312 aa15.43■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM170BA6NMN3 283 aa15.43■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KIAA0513O60268 411 aa15.43■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa15.43■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TBC1D25Q3MII6 688 aa15.43■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa15.43■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SNX29P2Q8IUI4 249 aa15.43■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRIM48Q8IWZ4 208 aa15.43■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TEX47Q8TBZ9 253 aa15.43■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CDS1Q92903 461 aa15.43■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LRR1Q96L50 414 aa15.43■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms