RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577827.5

PTPRM-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 4,640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-205ENST00000577827 LCTLQ6UWM7 567 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 BEST3Q8N1M1 668 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 THEM6Q8WUY1 208 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 SLC41A3Q96GZ6 507 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 BCL2L14Q9BZR8 327 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 HSFX1Q9UBD0 423 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 GRHPRQ9UBQ7 328 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 ACTL7AQ9Y615 435 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 DLEC1Q9Y238 1755 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 M0R3H8 397 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 CHP2O43745 196 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 KLK8O60259 260 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 PKLRP30613 574 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 FNTBP49356 437 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 ARF5P84085 180 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 TMPRSS12Q86WS5 348 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 OR2L3Q8NG85 312 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 OR5W2Q8NH69 310 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 YIPF6Q96EC8 236 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 ACTRT3Q9BYD9 372 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 OR10A4Q9H209 315 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 MVB12BQ9H7P6 319 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 TAF1P21675 1872 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 RTCAO00442 366 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 CSN2P05814 226 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 SRCP12931 536 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 HLA-EP13747 358 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 GNSP15586 552 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 HBA1P69905 142 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 SLC5A12Q1EHB4 618 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 RTP2Q5QGT7 225 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 SHFQ7M4L6 423 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 GALNT11Q8NCW6 608 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM38AQ9H6F2 299 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 BABAM2Q9NXR7 383 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 POLHQ9Y253 713 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 PRSS21Q9Y6M0 314 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 WASHC1A8K0Z3 465 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM150CB9EJG8 249 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 SCDO00767 359 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 FMO6PO60774 539 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 DRD5P21918 477 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 WASP42768 502 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 ASAH1Q13510 395 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 GALEQ14376 348 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 DECR1Q16698 335 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 INAVAQ3KP66 663 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 FLYWCH1Q4VC44 716 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 C3P1Q6ZMU1 363 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 IFNL1Q8IU54 200 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 OR56B4Q8NH76 319 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 NEIL2Q969S2 332 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 DGAT2Q96PD7 388 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF559Q9BR84 538 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 GABARAPL3Q9BY60 117 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM185BQ9H7F4 350 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 COPS7AQ9UBW8 275 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 OSGIN1Q9UJX0 560 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 NRAPQ86VF7 1730 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 ACOT7O00154 380 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 PGAM2P15259 253 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 FPGSQ05932 587 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM107Q6UX40 140 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 OR2L5Q8NG80 312 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 SGTBQ96EQ0 304 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 CDCA4Q9BXL8 241 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 XKR8Q9H6D3 395 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 SPHK2Q9NRA0 654 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 TTC34A8MYJ7 566 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 PHYHO14832 338 aa9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms