RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557549.5

RBM23-231, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-231	ENST00000557549	PINLYP	A6NC86	204 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	OR6C70	A6NIJ9	312 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	KIR3DP1	A8MWS1	328 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549		G3V3Y1	287 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	ACOT7	O00154	380 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	CCL21	O00585	134 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF195	O14628	629 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	ANKRD28	O15084	1053 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	SLC19A2	O60779	497 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	PPM1B	O75688	479 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	SNX4	O95219	450 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	CT45A8	P0DMV1	189 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	CT45A9	P0DMV2	189 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	KIT	P10721	976 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	LAMP1	P11279	417 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	PTGER1	P34995	402 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	CA7	P43166	264 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	DIO3	P55073	304 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	PER3	P56645	1201 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	PRR5	P85299	388 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	RBPJ	Q06330	500 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	HSPB3	Q12988	150 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	SNTA1	Q13424	505 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	C3AR1	Q16581	482 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	GSTA3	Q16772	222 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	CT45A2	Q5DJT8	189 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	ANKRD26P1	Q6NSI1	321 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	TMEM64	Q6YI46	380 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	GLB1L3	Q8NCI6	653 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	OR2M7	Q8NG81	312 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	OR7A2P	Q8NGA2	310 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	SPPL2A	Q8TCT8	520 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	MOAP1	Q96BY2	351 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	SLC35A4	Q96G79	324 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	DUSP26	Q9BV47	211 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	AIG1	Q9NVV5	245 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	TINAG	Q9UJW2	476 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	MRTO4	Q9UKD2	239 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF835	Q9Y2P0	537 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	DNAJC13	O75165	2243 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	MAST4	O15021	2626 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	EMC8	O43402	210 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	HS6ST1	O60243	411 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	CCL3	P10147	92 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	IDO1	P14902	403 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	EPHA3	P29320	983 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	KRT20	P35900	424 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	PNLIPRP2	P54317	469 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	PSG6	Q00889	435 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	PLCXD2	Q0VAA5	305 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	EFR3A	Q14156	821 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	VPS26B	Q4G0F5	336 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	ANXA8L1	Q5VT79	327 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	BHLHB9	Q6PI77	547 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	EPGN	Q6UW88	154 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	ACAD11	Q709F0	780 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	SLC22A16	Q86VW1	577 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	KRTCAP2	Q8N6L1	136 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	FAM13C	Q8NE31	585 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	OR10G3	Q8NGC4	313 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	TMCO6	Q96DC7	493 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	OMA1	Q96E52	524 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	IL1RL2	Q9HB29	575 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549		Q9N2J8	555 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	GIN1	Q9NXP7	522 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	QPCTL	Q9NXS2	382 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	BOK	Q9UMX3	212 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	TSPAN2	O60636	221 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	PDE9A	O76083	593 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	GLS	O94925	669 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	KRT16	P08779	473 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	FREM3	P0C091	2139 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	MAP3K8	P41279	467 aa		11.31	□□□□□ -0.6

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms