RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-204ENST00000546621 SPNP16150 400 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 TNNI3P19429 210 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 AHRP35869 848 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 SLC19A1P41440 591 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 UGT2B15P54855 530 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 RAC1P63000 192 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 HBA1P69905 142 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP7.33□□□□□ -1.242e-7■■■■□ 22.2
CS-204ENST00000546621 HEPACAMQ14CZ8 416 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 ZIC1Q15915 447 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 NKG7Q16617 165 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 MPEG1Q2M385 716 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 VMACQ2NL98 169 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 TMEM35AQ53FP2 167 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 HES5Q5TA89 166 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 ZNF425Q6IV72 752 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 UBE3DQ7Z6J8 389 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 PTOV1Q86YD1 416 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 MMP21Q8N119 569 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 TBC1D19Q8N5T2 526 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 ZBTB44Q8NCP5 570 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 OR4E2Q8NGC2 313 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 OR4M1Q8NGD0 313 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 GPBAR1Q8TDU6 330 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 ST8SIA4Q92187 359 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 HLA-CQ95604 372 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 TM4SF18Q96CE8 201 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 TMEM68Q96MH6 324 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 DPH7Q9BTV6 452 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 SARGQ9BW04 601 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 GPR174Q9BXC1 333 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 UCK2Q9BZX2 261 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 AICDAQ9GZX7 198 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 CHST8Q9H2A9 424 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 LHX9Q9NQ69 397 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 GPR27Q9NS67 375 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 C2orf42Q9NWW7 574 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 TAAR2Q9P1P5 351 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 MALT1Q9UDY8 824 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 ZNF639Q9UID6 485 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 KCNK7Q9Y2U2 307 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 FKBP7Q9Y680 259 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 MUC3AQ02505 3323 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 A0A0A6YYD5 115 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 TRAV20A0A0B4J274 112 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 A0A1W2PRB8 838 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 LINC00587B1AMM8 73 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 TMPRSS11DO60235 418 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 ZNF217O75362 1048 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 PRSS23O95084 383 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 CDK1P06493 297 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 CBLP22681 906 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 PCGF2P35227 344 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 SSR2P43308 183 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 VEZF1Q14119 521 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 EFR3AQ14156 821 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 GAS6Q14393 721 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 KIR2DS3Q14952 304 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 PLCL1Q15111 1095 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 RGNQ15493 299 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 CARTPTQ16568 116 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 AANATQ16613 207 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 PRSS53Q2L4Q9 553 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 ADPRMQ3LIE5 342 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 IQCCQ4KMZ1 466 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 PRRT3Q5FWE3 981 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 CLLU1Q5K131 121 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 OR4C11Q6IEV9 310 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 UTS2BQ765I0 119 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 CEP68Q76N32 757 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 GALNT10Q86SR1 603 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 ZBTB46Q86UZ6 589 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 SNX29P2Q8IUI4 249 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 TRIM48Q8IWZ4 208 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 CLEC4FQ8N1N0 589 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 UBE2J2Q8N2K1 259 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 DHRSXQ8N5I4 330 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 MFSD9Q8NBP5 474 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 OR52N2Q8NGI0 321 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 SLC22A18Q96BI1 424 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 ZDHHC12Q96GR4 267 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-204ENST00000546621 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms