RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF675Q8TD23 568 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 ADAMTS15Q8TE58 950 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 FAR1Q8WVX9 515 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 DNASE2BQ8WZ79 361 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 FKBP10Q96AY3 582 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 CTHRC1Q96CG8 243 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 DGCR6LQ9BY27 220 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 SAP130Q9H0E3 1048 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF556Q9HAH1 456 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 ENAMQ9NRM1 1142 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 STARD5Q9NSY2 213 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 SCN3BQ9NY72 215 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 NDOR1Q9UHB4 597 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 ENOPH1Q9UHY7 261 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 TMCC3Q9ULS5 477 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 SPACA6W5XKT8 324 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BP2-209ENST00000504450 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 K7ESF4 209 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 SGK494L7N484 410 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 CHST10O43529 356 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 FCMRO60667 390 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 TPST2O60704 377 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM20BO75063 409 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 NME6O75414 186 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 ATE1O95260 518 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 MT-ND2P03891 347 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 TP53P04637 393 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 ALPPP05187 535 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC35E2P0CK97 266 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 OSMP13725 252 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 BCKDHBP21953 392 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 CDH3P22223 829 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 CHMP24386 653 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 PRKAR1BP31321 381 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 KRT20P35900 424 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 MASP1P48740 699 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 PDX1P52945 283 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 GP2P55259 537 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 SHC2P98077 582 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 ID2Q02363 134 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 INAVAQ3KP66 663 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 ATAD3BQ5T9A4 648 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 GPR107Q5VW38 600 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 PODNL1Q6PEZ8 512 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC36A4Q6YBV0 504 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 FRRS1Q6ZNA5 592 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM92BQ6ZTR7 304 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 DEPDC4Q8N2C3 294 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 LINC00471Q8N535 108 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 MORN4Q8NDC4 146 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC7A13Q8TCU3 470 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 NR4A3Q92570 626 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 COL26A1Q96A83 441 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 TCTN2Q96GX1 697 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 PRRC1Q96M27 445 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 MAP3K3Q99759 626 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 CCDC3Q9BQI4 270 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 UCK2Q9BZX2 261 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 RAB33BQ9H082 229 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 PIGUQ9H490 435 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 EQTNQ9NQ60 294 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 MAT2BQ9NZL9 334 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 EPHA6Q9UF33 1036 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 SNX5Q9Y5X3 404 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 DCHS1Q96JQ0 3298 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 H3BMQ9 156 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 AQP9O43315 295 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 RGS10O43665 173 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 LDB3O75112 727 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 RDH16O75452 317 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 INMTO95050 263 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 POU2F1P14859 743 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 S1PR1P21453 382 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP10.07□□□□□ -0.85e-8■□□□□ 10
SH3BP2-209ENST00000504450 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 MAP4K2Q12851 820 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 DUSP5Q16690 384 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 DEFB110Q30KQ9 67 aa10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms