RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
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SH3BP2-208ENST00000504294 CT45A9P0DMV2 189 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP2-208ENST00000504294 EDN3P14138 238 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP2-208ENST00000504294 UQCRC2P22695 453 aa13.4□□□□□ -0.26
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SH3BP2-208ENST00000504294 GUCY1A3Q02108 690 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP2-208ENST00000504294 PRSS53Q2L4Q9 553 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP13.4□□□□□ -0.262e-6■□□□□ 8.1
SH3BP2-208ENST00000504294 CT45A2Q5DJT8 189 aa13.4□□□□□ -0.26
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SH3BP2-208ENST00000504294 SLC22A16Q86VW1 577 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP2-208ENST00000504294 SULF2Q8IWU5 870 aa13.4□□□□□ -0.26
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SH3BP2-208ENST00000504294 ADAMTS15Q8TE58 950 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP2-208ENST00000504294 GRHL3Q8TE85 626 aa13.4□□□□□ -0.26
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SH3BP2-208ENST00000504294 PANX1Q96RD7 426 aa13.4□□□□□ -0.26
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SH3BP2-208ENST00000504294 METTL7AQ9H8H3 244 aa13.4□□□□□ -0.26
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SH3BP2-208ENST00000504294 J3QKU1 62 aa13.39□□□□□ -0.27
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SH3BP2-208ENST00000504294 NKX2-2O95096 273 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 ANP32DO95626 131 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 KRT75O95678 551 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF24P17028 368 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
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SH3BP2-208ENST00000504294 GABRA3P34903 492 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 SOX18P35713 384 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 PIGAP37287 484 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 TRPC1P48995 793 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 MEOX1P50221 254 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 CDK9P50750 372 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 MLLT10P55197 1068 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 KCNJ2P63252 427 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 HBA1P69905 142 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 PSG6Q00889 435 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 PLGLB1Q02325 96 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 DUSP8Q13202 625 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 MFSD12Q6NUT3 480 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 CDC73Q6P1J9 531 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 LYPD8Q6UX82 237 aa13.39□□□□□ -0.27
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SH3BP2-208ENST00000504294 SLC9A6Q92581 669 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
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SH3BP2-208ENST00000504294 DOHHQ9BU89 302 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 PIGUQ9H490 435 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 IL1RL2Q9HB29 575 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 SH2D2AQ9NP31 389 aa13.39□□□□□ -0.27
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SH3BP2-208ENST00000504294 QPCTLQ9NXS2 382 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 LUZP4Q9P127 313 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 KLHL14Q9P2G3 628 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 CCDC154A6NI56 674 aa13.38□□□□□ -0.27
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SH3BP2-208ENST00000504294 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 ZCCHC18P0CG32 403 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 ATP6V1C1P21283 382 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 PTGER1P34995 402 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 NME5P56597 212 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 FOXK1P85037 733 aa13.38□□□□□ -0.27
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SH3BP2-208ENST00000504294 OR2M7Q8NG81 312 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 OR10G3Q8NGC4 313 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 OIT3Q8WWZ8 545 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 JADE3Q92613 823 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 TMBIM1Q969X1 311 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF597Q96LX8 424 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 FRMD6Q96NE9 622 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 EBF4Q9BQW3 602 aa13.38□□□□□ -0.27
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SH3BP2-208ENST00000504294 RAD21L1Q9H4I0 556 aa13.38□□□□□ -0.27
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