RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498367.1

PDCD4-211, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD4, Length 975 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-211ENST00000498367 RFX3P48380 749 aa6.76□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 CCL11P51671 97 aa6.76□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 ACLYP53396 1101 aa6.76□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 MTCP1P56278 107 aa6.76□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 HERVK_113P63132 956 aa6.76□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 ERVK-25P63136 954 aa6.76□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 SPA17Q15506 151 aa6.76□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 FAM90A2PQ658T7 463 aa6.76□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 OR52W1Q6IF63 320 aa6.76□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 FAM71F2Q6NXP2 309 aa6.76□□□□□ -1.33
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PDCD4-211ENST00000498367 C17orf107Q6ZR85 190 aa6.76□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 MOB3CQ70IA8 216 aa6.76□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 OTOP2Q7RTS6 562 aa6.76□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa6.76□□□□□ -1.33
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PDCD4-211ENST00000498367 REPS2Q8NFH8 660 aa6.76□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa6.76□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 SUSD6Q92537 303 aa6.76□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP6.76□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 GLG1Q92896 1179 aa6.76□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 MCHR2Q969V1 340 aa6.76□□□□□ -1.33
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PDCD4-211ENST00000498367 ORAI1Q96D31 301 aa6.76□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
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PDCD4-211ENST00000498367 ACOX2Q99424 681 aa6.76□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 COPS8Q99627 209 aa6.76□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa6.76□□□□□ -1.33
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PDCD4-211ENST00000498367 DUSP26Q9BV47 211 aa6.76□□□□□ -1.33
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PDCD4-211ENST00000498367 OR10A5Q9H207 317 aa6.76□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 ADAMTS10Q9H324 1103 aa6.76□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 PIGMQ9H3S5 423 aa6.76□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 DCLRE1BQ9H816 532 aa6.76□□□□□ -1.33
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PDCD4-211ENST00000498367 MIOSQ9NXC5 875 aa6.76□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 OPN4Q9UHM6 478 aa6.76□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 ANAPC7Q9UJX3 599 aa6.76□□□□□ -1.33
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PDCD4-211ENST00000498367 RTL9Q8NET4 1388 aa6.76□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 NUP160Q12769 1436 aa6.76□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.334e-6■■■■■ 31
PDCD4-211ENST00000498367 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 A0A1W2PQ27 194 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 A0A1W2PQ64 194 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 A0A1W2PQC6 194 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 FAM90A10PA6NDY2 464 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 F8W036 122 aa6.75□□□□□ -1.33
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PDCD4-211ENST00000498367 TOX4O94842 621 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 ANGPTL1O95841 491 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 APRTP07741 180 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 CD63P08962 238 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM225BP0DP42 221 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 THRAP10827 490 aa6.75□□□□□ -1.33
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PDCD4-211ENST00000498367 GSSP48637 474 aa6.75□□□□□ -1.33
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PDCD4-211ENST00000498367 LCN2P80188 198 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 CHRNEQ04844 493 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 GRM7Q14831 915 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 OR4D1Q15615 310 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 EFNB3Q15768 340 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM249Q2WGJ8 235 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 LPCAT4Q643R3 524 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 BICRALQ6AI39 1079 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 ELP2Q6IA86 826 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 UGT3A1Q6NUS8 523 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 AADACL2Q6P093 401 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 BHLHB9Q6PI77 547 aa6.75□□□□□ -1.33
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