RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495399.1

C9orf135-204, Transcript of chromosome 9 open reading frame 135, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf135, Length 502 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-204ENST00000495399 LRTM1Q9HBL6 345 aa6.85□□□□□ -1.31
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C9orf135-204ENST00000495399 VPS29Q9UBQ0 182 aa6.85□□□□□ -1.31
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C9orf135-204ENST00000495399 A8MUA0 341 aa6.83□□□□□ -1.32
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C9orf135-204ENST00000495399 FAM229AH3BQW9 127 aa6.83□□□□□ -1.32
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C9orf135-204ENST00000495399 B4GALT2O60909 372 aa6.83□□□□□ -1.32
C9orf135-204ENST00000495399 ATP6AP2O75787 350 aa6.83□□□□□ -1.32
C9orf135-204ENST00000495399 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
C9orf135-204ENST00000495399 FAM58BPP0C7Q3 252 aa6.83□□□□□ -1.32
C9orf135-204ENST00000495399 RNH1P13489 461 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
C9orf135-204ENST00000495399 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
C9orf135-204ENST00000495399 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP6.83□□□□□ -1.32
C9orf135-204ENST00000495399 ASCL1P50553 236 aa6.83□□□□□ -1.32
C9orf135-204ENST00000495399 HLCSP50747 726 aa6.83□□□□□ -1.32
C9orf135-204ENST00000495399 HK2P52789 917 aa6.83□□□□□ -1.32
C9orf135-204ENST00000495399 MLF1P58340 268 aa6.83□□□□□ -1.32
C9orf135-204ENST00000495399 GPR85P60893 370 aa6.83□□□□□ -1.32
C9orf135-204ENST00000495399 SKP1P63208 163 aa6.83□□□□□ -1.32
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