RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 SH3D21A4FU49 640 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 ARHGAP33O14559 1287 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 PRKYO43930 277 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 FCMRO60667 390 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 ACTR1BP42025 376 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 ACTR1AP61163 376 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 MAP4K2Q12851 820 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 SDE2Q6IQ49 451 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 FBXO42Q6P3S6 717 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 PAQR7Q86WK9 346 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 UBE2J2Q8N2K1 259 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 MORN4Q8NDC4 146 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 KBTBD8Q8NFY9 601 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 ELP4Q96EB1 424 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 CRELD1Q96HD1 420 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 BMFQ96LC9 184 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 BCL2L10Q9HD36 194 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 CLEC1BQ9P126 229 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 SNX7Q9UNH6 387 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 FANCMQ8IYD8 2048 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 A0A1W2PRQ8 180 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 WWP2O00308 870 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 APOL3O95236 402 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 FHP07954 510 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 PTNP21246 168 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 SOX3P41225 446 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 OLR1P78380 273 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 ID2Q02363 134 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 GINS1Q14691 196 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 CASP12Q6UXS9 341 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 ATCAYQ86WG3 371 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 SLC34A3Q8N130 599 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 BBS10Q8TAM1 723 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 RASSF5Q8WWW0 418 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 FAM131CQ96AQ9 280 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 TXNDC15Q96J42 360 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 SLC38A1Q9H2H9 487 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 SRMSQ9H3Y6 488 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 EGLN3Q9H6Z9 239 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 CPNE5Q9HCH3 593 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 CHST2Q9Y4C5 530 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 ISPDA4D126 451 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 SAGE2PA6NJ88 616 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 P2RX6O15547 441 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 DYRK3O43781 588 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 MPZL2O60487 215 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 CTSVO60911 334 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 RASGRP1O95267 797 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 ZNF181Q2M3W8 571 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 FBXO43Q4G163 708 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 PRRT3Q5FWE3 981 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 TMEM64Q6YI46 380 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 ZNF367Q7RTV3 350 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 PATE1Q8WXA2 126 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 SLC35A4Q96G79 324 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 OPALINQ96PE5 141 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 KCNS3Q9BQ31 491 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 TSSK6Q9BXA6 273 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 SP140LQ9H930 580 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 ZSCAN32Q9NX65 697 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 VCANP13611 3396 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 ZNF860A6NHJ4 632 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 EMC8O43402 210 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 KIAA0513O60268 411 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 GPX5O75715 221 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 KRT8P05787 483 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 CHRNB1P11230 501 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 CTHP32929 405 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 LIMK1P53667 647 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 SMIM11AP58511 58 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 ZNF91Q05481 1191 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 DEFB134Q4QY38 66 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 ZNF311Q5JNZ3 666 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 ATAD3CQ5T2N8 411 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 FAM111BQ6SJ93 734 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 MTSS1LQ765P7 747 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 KIF18BQ86Y91 864 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 OR10G6Q8NH81 332 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 CITED4Q96RK1 184 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-213ENST00000492657 KLF15Q9UIH9 416 aa12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.7 ms