RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464168.5

USP4-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 4

Gene USP4, Length 601 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-208ENST00000464168 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa20.5■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 A0A1W2PNV4 684 aa20.49■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 ZIC3O60481 467 aa20.49■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 SMIM24O75264 130 aa20.49■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 NME6O75414 186 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 TGM6O95932 706 aa20.49■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 RPS17P08708 135 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 CT45A8P0DMV1 189 aa20.49■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 CT45A9P0DMV2 189 aa20.49■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 ZNF708P17019 499 aa20.49■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 ALDH9A1P49189 494 aa20.49■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 DIO3P55073 304 aa20.49■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 CT45A2Q5DJT8 189 aa20.49■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 SCIMPQ6UWF3 145 aa20.49■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 CLEC9AQ6UXN8 241 aa20.49■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa20.49■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 SELENOMQ8WWX9 145 aa20.49■□□□□ 0.87
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USP4-208ENST00000464168 FAIM2Q9BWQ8 316 aa20.49■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 HEY2Q9UBP5 337 aa20.49■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 ZNF225Q9UK10 706 aa20.49■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 UTS2RQ9UKP6 389 aa20.49■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
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USP4-208ENST00000464168 B4DXG7 233 aa20.48■□□□□ 0.87
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USP4-208ENST00000464168 TSPAN2O60636 221 aa20.48■□□□□ 0.87
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USP4-208ENST00000464168 OTCP00480 354 aa20.48■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 TSPAN8P19075 237 aa20.48■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 CDH13P55290 713 aa20.48■□□□□ 0.87
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USP4-208ENST00000464168 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
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USP4-208ENST00000464168 FAM27E3Q08E93 113 aa20.48■□□□□ 0.87
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USP4-208ENST00000464168 OR5M10Q6IEU7 315 aa20.48■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 CCDC116Q8IYX3 515 aa20.48■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 ZNF675Q8TD23 568 aa20.48■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 RNF138Q8WVD3 245 aa20.48■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 ARSGQ96EG1 525 aa20.48■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 SFXN2Q96NB2 322 aa20.48■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 HBEGFQ99075 208 aa20.48■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 NINJ2Q9NZG7 142 aa20.48■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 SNX6Q9UNH7 406 aa20.48■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 CSPG4Q6UVK1 2322 aa20.47■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 MSTNO14793 375 aa20.47■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 SIAH2O43255 324 aa20.47■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 PHBP35232 272 aa20.47■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 GAS1P54826 345 aa20.47■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 BCL2A1Q16548 175 aa20.47■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 KAT2AQ92830 837 aa20.47■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 STARD4Q96DR4 205 aa20.47■□□□□ 0.87
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USP4-208ENST00000464168 NMRK1Q9NWW6 199 aa20.47■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
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USP4-208ENST00000464168 ARHGEF9O43307 516 aa20.46■□□□□ 0.87
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USP4-208ENST00000464168 SBK3P0C264 359 aa20.46■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 COL6A2P12110 1019 aa20.46■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 GRK2P25098 689 aa20.46■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 DPP4P27487 766 aa20.46■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 CPOXP36551 454 aa20.46■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 PCYT1AP49585 367 aa20.46■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 B3GALT5-AS1P59052 145 aa20.46■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 EFR3AQ14156 821 aa20.46■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa20.46■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 NPSR1Q6W5P4 371 aa20.46■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 TMEM151AQ8N4L1 468 aa20.46■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 ERP27Q96DN0 273 aa20.46■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 VSTM2LQ96N03 204 aa20.46■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa20.46■□□□□ 0.87
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USP4-208ENST00000464168 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
USP4-208ENST00000464168 DKKL1Q9UK85 242 aa20.46■□□□□ 0.87
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USP4-208ENST00000464168 DEFB108AA8MXU0 73 aa20.45■□□□□ 0.86
USP4-208ENST00000464168 ESRRBO95718 433 aa20.45■□□□□ 0.86
USP4-208ENST00000464168 CRHP06850 196 aa20.45■□□□□ 0.86
USP4-208ENST00000464168 HEXAP06865 529 aa20.45■□□□□ 0.86
USP4-208ENST00000464168 CTAGE8P0CG41 777 aa20.45■□□□□ 0.86
USP4-208ENST00000464168 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
USP4-208ENST00000464168 CASQ1P31415 396 aa20.45■□□□□ 0.86
USP4-208ENST00000464168 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
USP4-208ENST00000464168 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
USP4-208ENST00000464168 CTAGE4Q8IX94 777 aa20.45■□□□□ 0.86
USP4-208ENST00000464168 OR9A2Q8NGT5 310 aa20.45■□□□□ 0.86
USP4-208ENST00000464168 ZNF592Q92610 1267 aa20.45■□□□□ 0.86
USP4-208ENST00000464168 DTNBP1Q96EV8 351 aa20.45■□□□□ 0.86
USP4-208ENST00000464168 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
USP4-208ENST00000464168 PFDN4Q9NQP4 134 aa20.45■□□□□ 0.86
USP4-208ENST00000464168 TRPS1Q9UHF7 1281 aa20.45■□□□□ 0.86
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