RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441703.5

HDAC6-210, Transcript of histone deacetylase 6, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC6, Length 599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6-210ENST00000441703 USP10Q14694 798 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 PCSK7Q16549 785 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 RBBP7Q16576 425 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 IMPG1Q17R60 797 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 KRTCAP3Q53RY4 240 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 Q5BKY6 102 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 ZNF789Q5FWF6 425 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 FAM205BPQ63HN1 556 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 C3P1Q6ZMU1 363 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 SPATA19Q7Z5L4 167 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 CCDC190Q86UF4 302 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 STK32CQ86UX6 486 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 LRRTM4Q86VH4 590 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 CNTN4Q8IWV2 1026 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 ZZZ3Q8IYH5 903 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 CCNYL1Q8N7R7 359 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 GPR150Q8NGU9 434 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 OR5K1Q8NHB7 308 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 PROKR1Q8TCW9 393 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 MCOLN3Q8TDD5 553 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 KCTD4Q8WVF5 259 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 ZFPM2Q8WW38 1151 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 SLC7A6Q92536 515 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 SGCDQ92629 289 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 TMBIM1Q969X1 311 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 TBC1D20Q96BZ9 403 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 TMEM80Q96HE8 168 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 NSMCE2Q96MF7 247 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 GPR137Q96N19 417 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 SMIM14Q96QK8 99 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 UCK2Q9BZX2 261 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 NUAK2Q9H093 628 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 OR2AG1Q9H205 316 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 DCSTAMPQ9H295 470 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 FAM83DQ9H4H8 585 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 ZNF556Q9HAH1 456 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 LIN7BQ9HAP6 207 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 C1GALT1Q9NS00 363 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 TAS2R9Q9NYW1 312 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 EHD3Q9NZN3 535 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 IL17CQ9P0M4 197 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 PTGFRNQ9P2B2 879 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 ERVK-18Q9QC07 812 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 SLC23A2Q9UGH3 650 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 EGFL7Q9UHF1 273 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 KLHL21Q9UJP4 597 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 C3orf18Q9UK00 162 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 SLC39A10Q9ULF5 831 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 ZNF835Q9Y2P0 537 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 TLN2Q9Y4G6 2542 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 VPS13CQ709C8 3753 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 A0A075B6Q4 140 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 A0A1W2PP18 115 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 GSAPA4D1B5 854 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 OR2A25A4D2G3 310 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 OR6C74A6NCV1 312 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 TMEM233B4DJY2 109 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 G3V2T6 193 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 RGS10O43665 173 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 NDUFA2O43678 99 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 CRLF1O75462 422 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 EEDO75530 441 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 CLDN7O95471 211 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 PRAMEF1O95521 474 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 AP2A1O95782 977 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 FTH1P02794 183 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 DDX5P17844 614 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 ALOX12P18054 663 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 LBPP18428 481 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 IL1RNP18510 177 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 HRH2P25021 359 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 CHRNB4P30926 498 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 TGFBR2P37173 567 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 SLC26A3P40879 764 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 HNF4AP41235 474 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 PIK3CBP42338 1070 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 SLC9A3P48764 834 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 FOXL2P58012 376 aa6.04□□□□□ -1.44
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