RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439476.6

BDNF-211, Transcript of brain derived neurotrophic factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BDNF, Length 4,532 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDNF-211ENST00000439476 DECR1Q16698 335 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 C1orf94Q6P1W5 598 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 ZNF613Q6PF04 617 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 C12orf40Q86WS4 652 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 PIANPQ8IYJ0 282 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 ARMC10Q8N2F6 343 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 OR6K6Q8NGW6 343 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 ELP4Q96EB1 424 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 CCDC74BQ96LY2 380 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 FAM129BQ96TA1 746 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 SLC38A3Q99624 504 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 OR2AG1Q9H205 316 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 OR51E2Q9H255 320 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 CTPS2Q9NRF8 586 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 PRODH2Q9UF12 536 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 YIPF1Q9Y548 306 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 ZNF726A6NNF4 738 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 SCDO00767 359 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 MMP20O60882 483 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 GABARAPO95166 117 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 ADAP00813 363 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 HTR1AP08908 422 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 ITGAMP11215 1152 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 DRD2P14416 443 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 RHCEP18577 417 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 SLC14A2Q15849 920 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 TMEM35AQ53FP2 167 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 RAB41Q5JT25 222 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 TMEM207Q6UWW9 146 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 VITQ6UXI7 678 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 ZNF767PQ75MW2 155 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 SCD5Q86SK9 330 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 GPR149Q86SP6 731 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 NKAIN4Q8IVV8 208 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 TCEANCQ8N8B7 351 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 OR4K1Q8NGD4 311 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 OR52E4Q8NGH9 312 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 SETD6Q8TBK2 473 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 TSSK6Q9BXA6 273 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 SRRDQ9UH36 339 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 GLS2Q9UI32 602 aa6.06□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 GLTPD2A6NH11 291 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 SLC22A31A6NKX4 558 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 H7C2Y5 167 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 FXYD1O00168 92 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 UGDHO60701 494 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 MTX2O75431 263 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 QDPRP09417 244 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 IL7P13232 177 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 PGAM2P15259 253 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 CA5AP35218 305 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 E2F1Q01094 437 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 INAVAQ3KP66 663 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 ADPRMQ3LIE5 342 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 LRRC73Q5JTD7 316 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 MARCH8Q5T0T0 291 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 C1orf189Q5VU69 101 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 AGAP6Q5VW22 663 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 HACD4Q5VWC8 232 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 SUSD1Q6UWL2 747 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 CACUL1Q86Y37 369 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 GHDCQ8N2G8 530 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 SLC5A8Q8N695 610 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 ZNF615Q8N8J6 731 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 GDPD1Q8N9F7 314 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 PROKR2Q8NFJ6 384 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 TTC9Q92623 222 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 AGAP4Q96P64 663 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 DGAT2Q96PD7 388 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 ADAM19Q9H013 955 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 ADAP2Q9NPF8 381 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 RNF24Q9Y225 148 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 POM121BA6NF01 834 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 M0R233 179 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 RP2O75695 350 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 AHSA1O95433 338 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 TGFB1P01137 390 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 PTAFRP25105 342 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 S100A2P29034 98 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 RORAP35398 523 aa6.05□□□□□ -1.44
BDNF-211ENST00000439476 ETV6P41212 452 aa6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms