RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SIMC1Q8NDZ2 872 aa17.52■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR8J1Q8NGP2 316 aa17.52■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC37A2Q8TED4 501 aa17.52■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RSC1A1Q92681 617 aa17.52■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPA33Q99795 319 aa17.52■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRR14Q9BWN1 585 aa17.52■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HMG20AQ9NP66 347 aa17.52■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HRASLS2Q9NWW9 162 aa17.52■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CYP8B1Q9UNU6 501 aa17.52■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MTCH2Q9Y6C9 303 aa17.52■□□□□ 0.4
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CPMP14384 443 aa17.52■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GLULP15104 373 aa17.52■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRKAR1BP31321 381 aa17.52■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF846Q147U1 533 aa17.52■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RNF44Q7L0R7 432 aa17.52■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRSS41Q7RTY9 318 aa17.52■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IGFN1Q86VF2 1251 aa17.52■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IQCF1Q8N6M8 205 aa17.52■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHPT1Q8WUD6 406 aa17.52■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NR4A3Q92570 626 aa17.52■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDS1Q92903 461 aa17.52■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DCSTAMPQ9H295 470 aa17.52■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LYRM4Q9HD34 91 aa17.52■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A087WUU8 490 aa17.51■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa17.51■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A0G2JNG1 304 aa17.51■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A0J9YY10 115 aa17.51■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa17.51■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KIR2DS3K7RE56 304 aa17.51■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SULT1C4O75897 302 aa17.51■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GRK5P34947 590 aa17.51■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SOX18P35713 384 aa17.51■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RGS6P49758 472 aa17.51■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KIR2DS5Q14953 304 aa17.51■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ENTPD8Q5MY95 495 aa17.51■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FRRS1Q6ZNA5 592 aa17.51■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEFF1Q8IYR6 380 aa17.51■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa17.51■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TCEANCQ8N8B7 351 aa17.51■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR52P1PQ8NH57 321 aa17.51■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC9A6Q92581 669 aa17.51■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR5M11Q96RB7 305 aa17.51■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FBXO8Q9NRD0 319 aa17.51■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PTGFRNQ9P2B2 879 aa17.51■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ERGIC3Q9Y282 383 aa17.51■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SCN2AQ99250 2005 aa17.51■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR5K4A6NMS3 321 aa17.51■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CYP7B1O75881 506 aa17.51■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AGR2O95994 175 aa17.51■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HSMCR30P0CW71 290 aa17.51■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FZD2Q14332 565 aa17.51■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GJD3Q8N144 294 aa17.51■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CENPSQ8N2Z9 138 aa17.51■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa17.51■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 S100ZQ8WXG8 99 aa17.51■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DIO2Q92813 273 aa17.51■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC6A18Q96N87 628 aa17.51■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARMC7Q9H6L4 198 aa17.51■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MKLN1Q9UL63 735 aa17.51■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IFT52Q9Y366 437 aa17.51■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 THEGLP0DJG4 465 aa17.5■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PORP16435 677 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GSTM3P21266 225 aa17.5■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UGT2B10P36537 528 aa17.5■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AVPR1BP47901 424 aa17.5■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TUBA1BP68363 451 aa17.5■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ID2Q02363 134 aa17.5■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MED22Q15528 200 aa17.5■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OCLNQ16625 522 aa17.5■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF628Q5EBL2 1059 aa17.5■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MFSD4BQ5TF39 518 aa17.5■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MEDAGQ5VYS4 303 aa17.5■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TUBA1AQ71U36 451 aa17.5■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BTLAQ7Z6A9 289 aa17.5■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TAF8Q7Z7C8 310 aa17.5■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SHISA5Q8N114 240 aa17.5■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CLIP4Q8N3C7 705 aa17.5■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPR27Q9NS67 375 aa17.5■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SEMA4GQ9NTN9 838 aa17.5■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KLHL28Q9NXS3 571 aa17.5■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TVP23BQ9NYZ1 205 aa17.5■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP17.49■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GIPRP48546 466 aa17.49■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PPP1CAP62136 330 aa17.49■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF91Q05481 1191 aa17.49■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GINS1Q14691 196 aa17.49■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRAM2Q15035 370 aa17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.5 ms