RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
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PTPRJ-201ENST00000418331 GAREM2Q75VX8 874 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 SHFQ7M4L6 423 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM151AQ8N4L1 468 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 RTP3Q9BQQ7 232 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRJ-201ENST00000418331 C12orf4Q9NQ89 552 aa20.25■□□□□ 0.83
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