RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411092.1

RNU6-55P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 55, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-55P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-55P-201ENST00000411092 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-55P-201ENST00000411092 SCARB1Q8WTV0 552 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-55P-201ENST00000411092 SELENOMQ8WWX9 145 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-55P-201ENST00000411092 SOCS4Q8WXH5 440 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-55P-201ENST00000411092 GGHQ92820 318 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-55P-201ENST00000411092 DNASE1L2Q92874 299 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-55P-201ENST00000411092 PYCR2Q96C36 320 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-55P-201ENST00000411092 REPS1Q96D71 796 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-55P-201ENST00000411092 MTERF3Q96E29 417 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-55P-201ENST00000411092 PPP1R16AQ96I34 528 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-55P-201ENST00000411092 C7orf34Q96L11 122 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-55P-201ENST00000411092 FRG2BQ96QU4 278 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-55P-201ENST00000411092 OR2A14Q96R47 310 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-55P-201ENST00000411092 LYSMD1Q96S90 227 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-55P-201ENST00000411092 COQ7Q99807 217 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-55P-201ENST00000411092 H2AFJQ9BTM1 129 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-55P-201ENST00000411092 ALG8Q9BVK2 526 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-55P-201ENST00000411092 MND1Q9BWT6 205 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-55P-201ENST00000411092 TAPBPLQ9BX59 468 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-55P-201ENST00000411092 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-55P-201ENST00000411092 TPSD1Q9BZJ3 242 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-55P-201ENST00000411092 GPR63Q9BZJ6 419 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-55P-201ENST00000411092 CIPCQ9C0C6 399 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-55P-201ENST00000411092 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-55P-201ENST00000411092 CHST8Q9H2A9 424 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-55P-201ENST00000411092 TMEM38AQ9H6F2 299 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-55P-201ENST00000411092 MARCH7Q9H992 704 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-55P-201ENST00000411092 TPT1P8Q9HAU6 139 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZFP14Q9HCL3 533 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-55P-201ENST00000411092 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-55P-201ENST00000411092 ISYNA1Q9NPH2 558 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-55P-201ENST00000411092 SLAMF7Q9NQ25 335 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-55P-201ENST00000411092 SACM1LQ9NTJ5 587 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-55P-201ENST00000411092 DNAJC11Q9NVH1 559 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-55P-201ENST00000411092 RLIMQ9NVW2 624 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-55P-201ENST00000411092 CLN6Q9NWW5 311 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-55P-201ENST00000411092 NDUFB11Q9NX14 153 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-55P-201ENST00000411092 ARL15Q9NXU5 204 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-55P-201ENST00000411092 VNN3Q9NY84 501 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-55P-201ENST00000411092 TAS2R9Q9NYW1 312 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-55P-201ENST00000411092 PTTG3PQ9NZH4 202 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-55P-201ENST00000411092 SH3BP4Q9P0V3 963 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-55P-201ENST00000411092 CRLS1Q9UJA2 301 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-55P-201ENST00000411092 STOML2Q9UJZ1 356 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-55P-201ENST00000411092 POU2F3Q9UKI9 436 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-55P-201ENST00000411092 RAB23Q9ULC3 237 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-55P-201ENST00000411092 VPS4AQ9UN37 437 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-55P-201ENST00000411092 SNX7Q9UNH6 387 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-55P-201ENST00000411092 DUSP12Q9UNI6 340 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-55P-201ENST00000411092 CARD8Q9Y2G2 431 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-55P-201ENST00000411092 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-55P-201ENST00000411092 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-55P-201ENST00000411092 ASB4Q9Y574 426 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-55P-201ENST00000411092 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-55P-201ENST00000411092 U3KQV3 271 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-55P-201ENST00000411092 VWA8A3KMH1 1905 aa3.34□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 ALPK3Q96L96 1907 aa3.34□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 COL4A6Q14031 1691 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 TTC3P53804 2025 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 A0A0D9SEW6 157 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 C1orf226A1L170 272 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 HYKKA2RU49 373 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 CCDC182A6NF36 153 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 LOC730098B7Z3J9 87 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 H0YIV9 168 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 H3BQ06 376 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 hCG_2039718K7EN88 272 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 TNFRSF11BO00300 401 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 KIAA0513O60268 411 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 TLR5O60602 858 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 AP2A2O94973 939 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 MFN2O95140 757 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 PDYNP01213 254 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 TRBC1P01850 177 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 OR56A5P0C7T3 313 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 PIRTP0C851 137 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 CKMT1AP12532 417 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 IL7P13232 177 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 COX7A2P14406 83 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 RHCEP18577 417 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 GALP22466 123 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 CBLP22681 906 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 CPN2P22792 545 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 CHMP24386 653 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 CXCR2P25025 360 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 NR4A2P43354 598 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 GSTM5P46439 218 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 PGFP49763 221 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-55P-201ENST00000411092 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 437.9 ms