RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411083.1

RNU6-1135P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1135, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1135P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CAPNS2Q96L46 248 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 GHITMQ9H3K2 345 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PDRG1Q9NUG6 133 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 HAUS2Q9NVX0 235 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TBC1D29Q9UFV1 150 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 RPS6KA6Q9UK32 745 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 FCGR3BO75015 233 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CLN5O75503 358 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 GRAP2O75791 330 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PGM3O95394 542 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 IGHV3-48P01763 117 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 GLAP06280 429 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 OR8U8P0C7N1 319 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SAA4P35542 130 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PUDPQ08623 228 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CETN1Q12798 172 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 EPS8Q12929 822 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 STK4Q13043 487 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 LIPKQ5VXJ0 399 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 NANOGP8Q6NSW7 305 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 RHBDD2Q6NTF9 364 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ACP7Q6ZNF0 438 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CREBRFQ8IUR6 639 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 RAET1EQ8TD07 263 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 RAD54LQ92698 747 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 FGGYQ96C11 551 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 FOXC2Q99958 501 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 C19orf43Q9BQ61 176 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 FEM1AQ9BSK4 669 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 GPR174Q9BXC1 333 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 UNC45AQ9H3U1 944 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SOHLH2Q9NX45 425 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 EMCNQ9ULC0 261 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 A0A0A6YYD4 124 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 A0A0B4J203 849 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TRBC2A0A5B9 178 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 MEI4A8MW99 385 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 BEST1O76090 585 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CSF2P04141 144 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PCCBP05166 539 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CISD3P0C7P0 127 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PORP16435 677 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CCR4P51679 360 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CRISP3P54108 245 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PTENP60484 403 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 NOP14P78316 857 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 KLHL30Q0D2K2 578 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SLC39A6Q13433 755 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 COX19Q49B96 90 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PM20D1Q6GTS8 502 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 STEAP1BQ6NZ63 245 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 FAM180BQ6P0A1 224 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 LUZP1Q86V48 1076 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 C12orf56Q8IXR9 622 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 OR6J1Q8NGC5 347 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PDXPQ96GD0 296 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 STACQ99469 402 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TXN2Q99757 166 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 GDF3Q9NR23 364 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PIGVQ9NUD9 493 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 GDAP2Q9NXN4 497 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 WDR35Q9P2L0 1181 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 DUSP12Q9UNI6 340 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 IFT52Q9Y366 437 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 LAMB2P55268 1798 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 FRMPD3Q5JV73 1810 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 DHRS7CA6NNS2 312 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 MSH4O15457 936 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PDE5AO76074 875 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 GBAP04062 536 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 VDAC1P21796 283 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 NF2P35240 595 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 RDXP35241 583 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 DLSTP36957 453 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 METAP1P53582 386 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 WTAPQ15007 396 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 BMP2KLQ5H9B9 411 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 LGSNQ5TDP6 509 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1135P-201ENST00000411083 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.9 ms