RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 POLE4Q9NR33 117 aa22.32■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa22.32■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 CYP7B1O75881 506 aa22.31■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 APOA1P02647 267 aa22.31■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 ALPPP05187 535 aa22.31■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 ACP2P11117 423 aa22.31■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 PRKAG1P54619 331 aa22.31■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 ST3GAL3Q11203 375 aa22.31■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 SLC13A2Q13183 592 aa22.31■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 DOC2BQ14184 412 aa22.31■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 LRRC32Q14392 662 aa22.31■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 ATAD3BQ5T9A4 648 aa22.31■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 SLC27A4Q6P1M0 643 aa22.31■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 SLC36A4Q6YBV0 504 aa22.31■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 NRROSQ86YC3 692 aa22.31■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 GAL3ST3Q96A11 431 aa22.31■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 CNPPD1Q9BV87 410 aa22.31■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 TRPV5Q9NQA5 729 aa22.31■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 SLC13A4Q9UKG4 626 aa22.31■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 FBXW2Q9UKT8 454 aa22.31■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 CKMT1AP12532 417 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 ALOX12P18054 663 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 IGFALSP35858 605 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 RPS19P39019 145 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 ZNF311Q5JNZ3 666 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 ACSM5Q6NUN0 579 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 FBXL6Q8N531 539 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 CLDN22Q8N7P3 220 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 NUP43Q8NFH3 380 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 TEX47Q8TBZ9 253 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 NT5CQ8TCD5 201 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 LRR1Q96L50 414 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 SLC38A2Q96QD8 506 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 MED18Q9BUE0 208 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 ACTRT3Q9BYD9 372 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 KLHL28Q9NXS3 571 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 A0A087WUU8 490 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 A0A1W2PQU0 124 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 ATP6V1G1O75348 118 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 SRFP11831 508 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 TNFSF8P32971 234 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 DGKEP52429 567 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 GAS1P54826 345 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 DIO2Q92813 273 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 TMCO6Q96DC7 493 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 GPSM3Q9Y4H4 160 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 NINQ8N4C6 2090 aa22.3■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 GAAP10253 952 aa22.29■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 NR2F6P10588 404 aa22.29■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 MYL12AP19105 171 aa22.29■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 SOX3P41225 446 aa22.29■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 TMED10P49755 219 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 TAS2R41P59536 307 aa22.29■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 RUNX1T1Q06455 604 aa22.29■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 TPBGQ13641 420 aa22.29■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 SNAPC1Q16533 368 aa22.29■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 DECR1Q16698 335 aa22.29■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 MINDY4Q4G0A6 757 aa22.29■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 TMEM107Q6UX40 140 aa22.29■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 TRIM73Q86UV7 250 aa22.29■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 PAQR7Q86WK9 346 aa22.29■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 HPS1Q92902 700 aa22.29■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 SLC22A18Q96BI1 424 aa22.29■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 GPA33Q99795 319 aa22.29■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 TWSG1Q9GZX9 223 aa22.29■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa22.29■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 MED17Q9NVC6 651 aa22.29■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 FBXL12Q9NXK8 326 aa22.29■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 GLOD5A6NK44 160 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 OR52A4PA6NMU1 304 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 WASHC1A8K0Z3 465 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 CTHP32929 405 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 STAT5AP42229 794 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 WASP42768 502 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 SEPHS1P49903 392 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 WNT4P56705 351 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 KIAA1024LP59773 190 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 DUSP2Q05923 314 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 C18orf63Q68DL7 685 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 USP30Q70CQ3 517 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 TMEM145Q8NBT3 493 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 TEX12Q9BXU0 123 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 INIPQ9NRY2 104 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 NPAP1Q9NZP6 1156 aa22.28■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 KLF15Q9UIH9 416 aa22.28■■□□□ 1.16
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