RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397040.5

RALGAPB-202, Transcript of Ral GTPase activating protein non-catalytic beta subunit, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene RALGAPB, Length 8,435 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGAPB-202ENST00000397040 GRHL1Q9NZI5 618 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 IKZF3Q9UKT9 509 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 PROM1O43490 865 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 CSF2P04141 144 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 AOAHP28039 575 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 CD83Q01151 205 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 ZNF773Q6PK81 442 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 RFLNAQ6ZTI6 216 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 KMT5CQ86Y97 462 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 ZNF595Q8IYB9 648 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 TEX26Q8N6G2 289 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 OR10A6Q8NH74 314 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 RNFT2Q96EX2 444 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 CRELD1Q96HD1 420 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 BMFQ96LC9 184 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 MED28Q9H204 178 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 CKLFQ9UBR5 152 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 ERVK-19Q9WJR5 959 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 LTBP1Q14766 1721 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 DLX3O60479 287 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 STK17BO94768 372 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 RPS17P08708 135 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 SLC18A2Q05940 514 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 MSS51Q4VC12 460 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 GLYATQ6IB77 296 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 LNX2Q8N448 690 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 OR4K1Q8NGD4 311 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 LRRC61Q9BV99 259 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 TOR3AQ9H497 397 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 SIAEQ9HAT2 523 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 ACTR3BQ9P1U1 418 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 TNFRSF11BO00300 401 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 CHST10O43529 356 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 NPR2P20594 1047 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 ACVR2AP27037 513 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 PSMB5P28074 263 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 CD40LGP29965 261 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 OR3A3P47888 321 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 PCDH1Q08174 1060 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 BCL7AQ4VC05 210 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 SLX4IPQ5VYV7 408 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 ATG9BQ674R7 924 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 SMARCD3Q6STE5 483 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 MUCL1Q96DR8 90 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 ZNF778Q96MU6 729 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 S1PR5Q9H228 398 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 GPR83Q9NYM4 423 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 RDH8Q9NYR8 311 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 STX11O75558 287 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 AHRP35869 848 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 KCNAB1Q14722 419 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 ZNF585AQ6P3V2 769 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 PIANPQ8IYJ0 282 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 PRR22Q8IZ63 422 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 VWA5B2Q8N398 1253 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 MFSD9Q8NBP5 474 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 CHTF18Q8WVB6 975 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 FATE1Q969F0 183 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 NT5C3BQ969T7 300 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 TXNDC15Q96J42 360 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 SMIM14Q96QK8 99 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 CIB1Q99828 191 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 PSD2Q9BQI7 771 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 ALOX12BO75342 701 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 TGM6O95932 706 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 CHRNGP07510 517 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 C7P10643 843 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 NELFEP18615 380 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 S100GP29377 79 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 PGFP49763 221 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 CAMK2BQ13554 666 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 SSX2Q16385 188 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 SNAPC1Q16533 368 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 CDKL4Q5MAI5 379 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 NOXA1Q86UR1 476 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 PGBD5Q8N414 524 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 OR5T2Q8NGG2 359 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 OR1J4Q8NGS1 313 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 GTF2H4Q92759 462 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 CCDC120Q96HB5 630 aa5.05□□□□□ -1.6
RALGAPB-202ENST00000397040 GUCD1Q96NT3 240 aa5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms