RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 C9orf62Q8N4C0 152 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 FAM26EQ8N5C1 309 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 OR8K5Q8NH50 307 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 SOSTQ9BQB4 213 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 SARGQ9BW04 601 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 TEX12Q9BXU0 123 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ACTR6Q9GZN1 396 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ASB8Q9H765 288 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 GPR27Q9NS67 375 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ACER3Q9NUN7 267 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 UBQLN2Q9UHD9 624 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 CRLS1Q9UJA2 301 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 MOSPD1Q9UJG1 213 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 KCND3Q9UK17 655 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 CEP290O15078 2479 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 A0A0B4J293 547 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 I3L521 148 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 SLC28A2O43868 658 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ENTPD6O75354 484 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 STC2O76061 302 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 LRATO95237 230 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 WDPCPO95876 746 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 RAF1P04049 648 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 CSF2P04141 144 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 HLA-DPB1P04440 258 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 RHOCP08134 193 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 SLC6A12P48065 614 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 DGKGP49619 791 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 EVX1P49640 407 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ETV1P50549 477 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ABATP80404 500 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 SNTA1Q13424 505 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 CAMK1Q14012 370 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 IL18Q14116 193 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 DGKKQ5KSL6 1271 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ADGRF1Q5T601 910 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ARMC12Q5T9G4 340 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 LYPD4Q6UWN0 246 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM107Q6UX40 140 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 QSOX2Q6ZRP7 698 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM150AQ86TG1 271 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ADGRG3Q86Y34 549 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 PM20D2Q8IYS1 436 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 OR8H3Q8N146 312 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF680Q8NEM1 530 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 HGDQ93099 445 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 RNF31Q96EP0 1072 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 APIPQ96GX9 242 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 OR2M2Q96R28 347 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 JAM3Q9BX67 310 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 MIXL1Q9H2W2 232 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 MAT2BQ9NZL9 334 aa6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 HELZP42694 1942 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 C7orf66A4D0T2 115 aa6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 C2orf78A6NCI8 922 aa6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 H0YIV9 168 aa6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 H3BM21 787 aa6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 CASKO14936 926 aa6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 CCL16O15467 120 aa6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 PAPLNO95428 1278 aa6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 GSTM3P21266 225 aa6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 TACR1P25103 407 aa6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 LTBRP36941 435 aa6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 SPAM1P38567 509 aa6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 SOX3P41225 446 aa6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 GDF5P43026 501 aa6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 CRATP43155 626 aa6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 XKP51811 444 aa6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 CDK6Q00534 326 aa6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF91Q05481 1191 aa6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 LRRC32Q14392 662 aa6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 DCST1Q5T197 706 aa6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 NCEH1Q6PIU2 408 aa6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa6.78□□□□□ -1.32
CTPS1-201ENST00000372616 GAREM2Q75VX8 874 aa6.78□□□□□ -1.32
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