RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP19.44■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 NTN1O95631 604 aa19.44■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC35G6P0C7Q6 338 aa19.44■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 GSTM3P21266 225 aa19.44■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 SOX3P41225 446 aa19.44■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 TAS2R41P59536 307 aa19.44■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 ADAM15Q13444 863 aa19.44■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 FCRL6Q6DN72 434 aa19.44■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 PAQR6Q6TCH4 344 aa19.44■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC34A3Q8N130 599 aa19.44■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP19.44■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 CLIP4Q8N3C7 705 aa19.44■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 OR8D4Q8NGM9 314 aa19.44■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC22A18Q96BI1 424 aa19.44■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP19.44■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 MS4A4EQ96PG1 132 aa19.44■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 MND1Q9BWT6 205 aa19.44■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 EGLN3Q9H6Z9 239 aa19.44■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM74BQ9NUR3 256 aa19.44■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP19.44■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa19.44■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 DNAJB6O75190 326 aa19.44■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 CYP7B1O75881 506 aa19.44■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP19.44■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 PRKAR1BP31321 381 aa19.44■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP19.44■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 PRKCDQ05655 676 aa19.44■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 SPHARQ15513 63 aa19.44■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa19.44■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 FRRS1Q6ZNA5 592 aa19.44■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 C16orf62Q7Z3J2 963 aa19.44■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa19.44■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 NR4A3Q92570 626 aa19.44■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 QPCTLQ9NXS2 382 aa19.44■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 PILRAQ9UKJ1 303 aa19.44■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP19.44■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa19.44■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 FCMRO60667 390 aa19.43■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 ACADMP11310 421 aa19.43■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 TFF2Q03403 129 aa19.43■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 RUNX2Q13950 521 aa19.43■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 CDC73Q6P1J9 531 aa19.43■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC16A11Q8NCK7 471 aa19.43■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 SIMC1Q8NDZ2 872 aa19.43■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 PROKR2Q8NFJ6 384 aa19.43■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 OR52I1Q8NGK6 324 aa19.43■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 LRR1Q96L50 414 aa19.43■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 SERINC2Q96SA4 455 aa19.43■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 PHF11Q9UIL8 331 aa19.43■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP19.43■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM170BA6NMN3 283 aa19.43■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 TNFRSF10CO14798 259 aa19.43■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 RASGRP1O95267 797 aa19.43■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 ALOX5P09917 674 aa19.43■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 PORP16435 677 aaPredicted RBP19.43■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 NDUFV2P19404 249 aa19.43■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 CPN2P22792 545 aa19.43■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 SMSP52788 366 aa19.43■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 DNASE1L3Q13609 305 aa19.43■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 TRAM2Q15035 370 aa19.43■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 ALG11Q2TAA5 492 aa19.43■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM214AQ32MH5 1076 aa19.43■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM31Q5JXX7 168 aa19.43■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 ATAD3BQ5T9A4 648 aa19.43■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa19.43■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 LYSMD2Q8IV50 215 aa19.43■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 OR2L13Q8N349 312 aa19.43■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa19.43■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 ANKRD19PQ9H560 264 aa19.43■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 CFL2Q9Y281 166 aa19.43■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 UBXN7O94888 489 aa19.42■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 THY1P04216 161 aa19.42■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 OMPP47874 163 aa19.42■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP19.42■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 TSPAN31Q12999 210 aa19.42■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP19.42■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP19.42■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 GJD3Q8N144 294 aa19.42■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 CDS1Q92903 461 aa19.42■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP19.42■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 POLE4Q9NR33 117 aa19.42■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 NDUFB11Q9NX14 153 aa19.42■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 ACTR10Q9NZ32 417 aa19.42■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 ANKMY1Q9P2S6 941 aa19.42■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 DAPP1Q9UN19 280 aa19.42■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 ETV6P41212 452 aa19.42■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 CRYBB2P43320 205 aa19.42■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP19.42■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 GPR18Q14330 331 aa19.42■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 DEFB134Q4QY38 66 aa19.42■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM92Q6UXU6 159 aa19.42■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC22A16Q86VW1 577 aa19.42■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 OR52P1PQ8NH57 321 aa19.42■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 ADAMTS15Q8TE58 950 aa19.42■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 RIPOR3Q96MK2 946 aa19.42■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC28A3Q9HAS3 691 aa19.42■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP19.42■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 NTNG1Q9Y2I2 539 aa19.42■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 SCN2AQ99250 2005 aa19.41■□□□□ 0.7
KCNQ1-202ENST00000335475 SAGE2PA6NJ88 616 aa19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms