RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 CDC20Q12834 499 aa15.38■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 LTB4RQ15722 352 aa15.38■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 FLYWCH1Q4VC44 716 aa15.38■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM35AQ53FP2 167 aa15.38■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 MEDAGQ5VYS4 303 aa15.38■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 VRK2Q86Y07 508 aa15.38■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 OR9A2Q8NGT5 310 aa15.38■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 OR14C36Q8NHC7 312 aa15.38■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 IGFLR1Q9H665 355 aa15.38■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 SNTG1Q9NSN8 517 aa15.38■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 KCNN3Q9UGI6 736 aa15.38■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 GPR52Q9Y2T5 361 aa15.38■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa15.37■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 ERVH48-1M5A8F1 160 aa15.37■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 ETV5P41161 510 aa15.37■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 ETV1P50549 477 aa15.37■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 SGCGQ13326 291 aa15.37■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 LRRC32Q14392 662 aa15.37■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 SPANXN2Q5MJ10 180 aa15.37■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 DESI1Q6ICB0 168 aa15.37■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 SPATC1Q76KD6 591 aa15.37■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 CCDC190Q86UF4 302 aa15.37■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 OR52I1Q8NGK6 324 aa15.37■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 KAT2AQ92830 837 aa15.37■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM203Q969S6 136 aa15.37■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 OR2B2Q9GZK3 357 aa15.37■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 CPNE5Q9HCH3 593 aa15.37■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 BCL2L10Q9HD36 194 aa15.37■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 STMN3Q9NZ72 180 aa15.37■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 CYP7B1O75881 506 aa15.37■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 EML2O95834 649 aa15.37■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 PRKACAP17612 351 aa15.37■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 C5AR1P21730 350 aa15.37■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 TNFSF8P32971 234 aa15.37■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 IGFALSP35858 605 aa15.37■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 MXD1Q05195 221 aa15.37■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 OCLNQ16625 522 aa15.37■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa15.37■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 BBS10Q8TAM1 723 aa15.37■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 MND1Q9BWT6 205 aa15.37■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 FBXL12Q9NXK8 326 aa15.37■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 CES1P1Q9UKY3 287 aa15.37■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 NTNG1Q9Y2I2 539 aa15.37■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 A0A087WUU8 490 aa15.36■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 SLC31A1O15431 190 aa15.36■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 RGS5O15539 181 aa15.36■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 RPE65Q16518 533 aa15.36■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 SNAPC1Q16533 368 aa15.36■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 C1orf94Q6P1W5 598 aa15.36■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 GDPD3Q7L5L3 318 aa15.36■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa15.36■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 FAM26EQ8N5C1 309 aa15.36■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 KCT2Q8NC54 265 aa15.36■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 TTLQ8NG68 377 aa15.36■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 OR2L5Q8NG80 312 aa15.36■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 PRRC1Q96M27 445 aa15.36■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 OR7D2Q96RA2 312 aa15.36■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 CNIH4Q9P003 139 aa15.36■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 MSL3P1P0C860 447 aa15.36■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 PTGS2P35354 604 aa15.36■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 PHC2Q8IXK0 858 aa15.36■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 GALNT6Q8NCL4 622 aa15.36■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 SIMC1Q8NDZ2 872 aa15.36■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 OR4E2Q8NGC2 313 aa15.36■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 TIMM29Q9BSF4 260 aa15.36■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 SLC17A9Q9BYT1 436 aa15.36■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 SFXN1Q9H9B4 322 aa15.36■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 GDE1Q9NZC3 331 aa15.36■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 ENTPD4Q9Y227 616 aa15.36■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 CHST2Q9Y4C5 530 aa15.36■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa15.35■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 ISM1B1AKI9 464 aa15.35■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 GPR89AB7ZAQ6 455 aa15.35■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 GPR89BP0CG08 455 aa15.35■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 F3P13726 295 aa15.35■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 PTNP21246 168 aa15.35■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 CTAG1AP78358 180 aa15.35■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 CDK5Q00535 292 aa15.35■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 AGERQ15109 404 aa15.35■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF311Q5JNZ3 666 aa15.35■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 OR2G6Q5TZ20 316 aa15.35■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 SLC48A1Q6P1K1 146 aa15.35■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 USP30Q70CQ3 517 aa15.35■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 SHFQ7M4L6 423 aa15.35■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 SLC51BQ86UW2 128 aa15.35■□□□□ 0.05
SHQ1-201ENST00000325599 PROKR2Q8NFJ6 384 aa15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.1 ms