RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000304954.3

CSN3-201, Transcript of casein kappa, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSN3, Length 836 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3-201ENST00000304954 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa3.59□□□□□ -1.83
CSN3-201ENST00000304954 A0A0U1RRA0 63 aa3.59□□□□□ -1.83
CSN3-201ENST00000304954 FAM168BA1KXE4 195 aa3.59□□□□□ -1.83
CSN3-201ENST00000304954 TMEM89A2RUT3 159 aa3.59□□□□□ -1.83
CSN3-201ENST00000304954 A8MU10 97 aa3.59□□□□□ -1.83
CSN3-201ENST00000304954 A8MX80 341 aa3.59□□□□□ -1.83
CSN3-201ENST00000304954 E9PMD0 336 aa3.59□□□□□ -1.83
CSN3-201ENST00000304954 G3V3Y1 287 aa3.59□□□□□ -1.83
CSN3-201ENST00000304954 SGK494L7N484 410 aa3.59□□□□□ -1.83
CSN3-201ENST00000304954 RAMP1O60894 148 aa3.59□□□□□ -1.83
CSN3-201ENST00000304954 NDUFA7O95182 113 aa3.59□□□□□ -1.83
CSN3-201ENST00000304954 MEOX2P50222 304 aa3.59□□□□□ -1.83
CSN3-201ENST00000304954 ERVPABLB-1P60509 514 aa3.59□□□□□ -1.83
CSN3-201ENST00000304954 HAND2P61296 217 aa3.59□□□□□ -1.83
CSN3-201ENST00000304954 PAX2Q02962 417 aa3.59□□□□□ -1.83
CSN3-201ENST00000304954 SRYQ05066 204 aa3.59□□□□□ -1.83
CSN3-201ENST00000304954 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
CSN3-201ENST00000304954 LGSNQ5TDP6 509 aa3.59□□□□□ -1.83
CSN3-201ENST00000304954 LEG1Q6P5S2 330 aa3.59□□□□□ -1.83
CSN3-201ENST00000304954 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
CSN3-201ENST00000304954 CADM2Q8N3J6 435 aa3.59□□□□□ -1.83
CSN3-201ENST00000304954 FBXL16Q8N461 479 aa3.59□□□□□ -1.83
CSN3-201ENST00000304954 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
CSN3-201ENST00000304954 ZNF671Q8TAW3 534 aa3.59□□□□□ -1.83
CSN3-201ENST00000304954 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
CSN3-201ENST00000304954 NCLNQ969V3 563 aa3.59□□□□□ -1.83
CSN3-201ENST00000304954 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
CSN3-201ENST00000304954 SPATA13Q96N96 652 aa3.59□□□□□ -1.83
CSN3-201ENST00000304954 ELOVL4Q9GZR5 314 aa3.59□□□□□ -1.83
CSN3-201ENST00000304954 TNMDQ9H2S6 317 aa3.59□□□□□ -1.83
CSN3-201ENST00000304954 TMEM231Q9H6L2 316 aa3.59□□□□□ -1.83
CSN3-201ENST00000304954 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
CSN3-201ENST00000304954 MBD2Q9UBB5 411 aa3.59□□□□□ -1.83
CSN3-201ENST00000304954 GHRLQ9UBU3 117 aa3.59□□□□□ -1.83
CSN3-201ENST00000304954 PRODH2Q9UF12 536 aa3.59□□□□□ -1.83
CSN3-201ENST00000304954 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa3.59□□□□□ -1.83
CSN3-201ENST00000304954 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa3.59□□□□□ -1.83
CSN3-201ENST00000304954 UBE4BO95155 1302 aa3.59□□□□□ -1.83
CSN3-201ENST00000304954 HAT1O14929 419 aa3.58□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 TOXO94900 526 aa3.58□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 MT-ATP6P00846 226 aa3.58□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 PTMAP06454 111 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 PTPN6P29350 595 aa3.58□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 HMGCLP35914 325 aa3.58□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 STARD6P59095 220 aa3.58□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 ZNF33BQ06732 778 aa3.58□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 TGIF1Q15583 401 aa3.58□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 CAMK4Q16566 473 aa3.58□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 ZNF699Q32M78 642 aa3.58□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 LRIT3Q3SXY7 679 aa3.58□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 DCST2Q5T1A1 773 aa3.58□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 SEL1L2Q5TEA6 688 aa3.58□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa3.58□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 HDDC3Q8N4P3 179 aa3.58□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 FAM71CQ8NEG0 241 aa3.58□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 HCAR1Q9BXC0 346 aa3.58□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 GALPQ9UBC7 116 aa3.58□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 PLA2G4CQ9UP65 541 aa3.58□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 ABCC9O60706 1549 aa3.58□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 SAP18O00422 153 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 SLC17A2O00624 439 aa3.57□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 RASGRF2O14827 1237 aa3.57□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 SEC22BO75396 215 aa3.57□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 WNT2P09544 360 aa3.57□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 LAMP1P11279 417 aa3.57□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 SDC1P18827 310 aa3.57□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 GDF1P27539 372 aa3.57□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 MDH2P40926 338 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 PDIA5Q14554 519 aa3.57□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 RAB35Q15286 201 aa3.57□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 QRICH1Q2TAL8 776 aa3.57□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa3.57□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 LIPKQ5VXJ0 399 aa3.57□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 OR6B2Q6IFH4 312 aa3.57□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 CGB2Q6NT52 195 aa3.57□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 WDR88Q6ZMY6 472 aa3.57□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 VASH2Q86V25 355 aa3.57□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 PRR22Q8IZ63 422 aa3.57□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 RNF148Q8N7C7 305 aa3.57□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 OR52E1Q8NGJ3 308 aa3.57□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 RAB3CQ96E17 227 aa3.57□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 FAM114A2Q9NRY5 505 aa3.57□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 B4GALT7Q9UBV7 327 aa3.57□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 FETUBQ9UGM5 382 aa3.57□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 TTC26A0AVF1 554 aa3.56□□□□□ -1.84
CSN3-201ENST00000304954 FAM220BPB1ANY3 271 aa3.56□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms