RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000278833.3

ROM1-201, Transcript of retinal outer segment membrane protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ROM1, Length 1,878 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROM1-201ENST00000278833 SEPHS1P49903 392 aa23.51■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 SGCGQ13326 291 aa23.51■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 KRT33BQ14525 404 aa23.51■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa23.51■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 SLC27A4Q6P1M0 643 aa23.51■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 TEX47Q8TBZ9 253 aa23.51■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 NT5CQ8TCD5 201 aa23.51■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 ASB12Q8WXK4 309 aa23.51■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 HTRA1Q92743 480 aa23.51■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 GAL3ST3Q96A11 431 aa23.51■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 GIMAP5Q96F15 307 aa23.51■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 OR6C2Q9NZP2 312 aa23.51■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 GSAPA4D1B5 854 aa23.5■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 CTDSP2O14595 271 aa23.5■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 CYP7B1O75881 506 aa23.5■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 APOA1P02647 267 aa23.5■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 DNTTP04053 509 aa23.5■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 CERS1P27544 350 aa23.5■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 WNT4P56705 351 aa23.5■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 PSPHP78330 225 aa23.5■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 TPBGQ13641 420 aa23.5■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 GPAT3Q53EU6 434 aa23.5■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 TMEM107Q6UX40 140 aa23.5■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 GDPD3Q7L5L3 318 aa23.5■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 PAQR7Q86WK9 346 aa23.5■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 CCDC116Q8IYX3 515 aa23.5■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 CLIP4Q8N3C7 705 aa23.5■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 NUP43Q8NFH3 380 aa23.5■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 FBRSQ9HAH7 460 aa23.5■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 V9GYH0 126 aa23.5■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 SNPHO15079 494 aa23.49■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 MBTPS2O43462 519 aa23.49■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 AGR2O95994 175 aa23.49■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 NDUFS1P28331 727 aa23.49■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 ST3GAL3Q11203 375 aa23.49■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 LRRC32Q14392 662 aa23.49■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 ZNF311Q5JNZ3 666 aa23.49■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 ATAT1Q5SQI0 421 aa23.49■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 DESI1Q6ICB0 168 aa23.49■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 ASB15Q8WXK1 588 aa23.49■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 SLC25A46Q96AG3 418 aa23.49■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 APOOQ9BUR5 198 aa23.49■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 ACTRT3Q9BYD9 372 aa23.49■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 SLC17A9Q9BYT1 436 aa23.49■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 KLHL25Q9H0H3 589 aa23.49■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 MED17Q9NVC6 651 aa23.49■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 KLF15Q9UIH9 416 aa23.49■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa23.49■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 SPNP16150 400 aa23.49■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 MYL12AP19105 171 aa23.49■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 IFNA8P32881 189 aa23.49■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 TNFRSF4P43489 277 aa23.49■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 PRKAG1P54619 331 aa23.49■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 TAS2R41P59536 307 aa23.49■■□□□ 1.35
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ROM1-201ENST00000278833 C18orf63Q68DL7 685 aa23.49■■□□□ 1.35
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ROM1-201ENST00000278833 C10orf90Q96M02 699 aa23.49■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 SLC38A2Q96QD8 506 aa23.49■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 GLOD5A6NK44 160 aa23.48■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 WASHC1A8K0Z3 465 aa23.48■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 NR2F6P10588 404 aa23.48■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 FPR3P25089 353 aa23.48■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 STAT5AP42229 794 aa23.48■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 OMPP47874 163 aa23.48■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 KIAA1024LP59773 190 aa23.48■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
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ROM1-201ENST00000278833 SNAPC1Q16533 368 aa23.48■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 PLK5Q496M5 336 aa23.48■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 ATAD3BQ5T9A4 648 aa23.48■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
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ROM1-201ENST00000278833 YAF2Q8IY57 180 aa23.48■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 C16orf58Q96GQ5 468 aa23.48■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 KCNS3Q9BQ31 491 aa23.48■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa23.48■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 FBXL12Q9NXK8 326 aa23.48■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 SPHK1Q9NYA1 384 aa23.48■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa23.48■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa23.48■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa23.48■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 DOCK9Q9BZ29 2069 aa23.47■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 A0A1W2PQU0 124 aa23.47■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 DUXAA6NLW8 204 aa23.47■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 FAM170BA6NMN3 283 aa23.47■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 OR52A4PA6NMU1 304 aa23.47■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 KLF4O43474 513 aa23.47■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 ETV5P41161 510 aa23.47■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 MC3RP41968 323 aa23.47■■□□□ 1.35
ROM1-201ENST00000278833 ETV1P50549 477 aa23.47■■□□□ 1.35
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