RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 PSPHP78330 225 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 GPM6BQ13491 265 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 NDUFAF6Q330K2 333 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 TMEM201Q5SNT2 666 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 LILRA6Q6PI73 481 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 RTL4Q6ZR62 310 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 KRT74Q7RTS7 529 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 JAZF1Q86VZ6 243 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ACOT4Q8N9L9 421 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 OMA1Q96E52 524 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 XKR8Q9H6D3 395 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 FOLH1BQ9HBA9 442 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 OR10H1Q9Y4A9 318 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 SNX11Q9Y5W9 270 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ANKRD12Q6UB98 2062 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 GLOD5A6NK44 160 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 HMGN4O00479 90 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 GRK5P34947 590 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 EPHA5P54756 1037 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 IRF3Q14653 427 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 METRNLQ641Q3 311 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 AMIGO1Q86WK6 493 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 MS4A15Q8N5U1 240 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 SLC25A46Q96AG3 418 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 RIPOR3Q96MK2 946 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 OPALINQ96PE5 141 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 OR7D2Q96RA2 312 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 FBXL12Q9NXK8 326 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 MEIOCA2RUB1 952 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 LGI1O95970 557 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 CTSLP07711 333 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 CELP19835 753 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 GCGRP47871 477 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 ASAH1Q13510 395 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 PGGHGQ32M88 737 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 CD300LDQ6UXZ3 194 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 ZNF550Q7Z398 422 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 SLC43A2Q8N370 569 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 SIMC1Q8NDZ2 872 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 TRIM2Q9C040 744 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 ADAP2Q9NPF8 381 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 TBX21Q9UL17 535 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 CLDN4O14493 209 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 KAT7O95251 611 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 CH25HO95992 272 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 CTSEP14091 401 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 GNSP15586 552 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 DUSP7Q16829 419 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 UAP1L1Q3KQV9 507 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 TOMM5Q8N4H5 51 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 ART5Q96L15 291 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 MRGPRX3Q96LB0 322 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 YIPF2Q9BWQ6 316 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 CHST8Q9H2A9 424 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 OR51V1Q9H2C8 321 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 GLIPR2Q9H4G4 154 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 ASB6Q9NWX5 421 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 COPZ2Q9P299 210 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 EXTL2Q9UBQ6 330 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 MALT1Q9UDY8 824 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 KCND3Q9UK17 655 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 POLHQ9Y253 713 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 UBE2QL1A1L167 161 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 GPX5O75715 221 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 RASGRP1O95267 797 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 TACSTD2P09758 323 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 FPR3P25089 353 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 STOMP27105 288 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 PKLRP30613 574 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 ETV6P41212 452 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 LEXMQ3ZCV2 418 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 ENTPD8Q5MY95 495 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 SMARCD3Q6STE5 483 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 LHFPL3Q86UP9 236 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 FAM124AQ86V42 546 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 UBQLNLQ8IYU4 475 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 ZNF619Q8N2I2 560 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-201ENST00000264345 OR4E2Q8NGC2 313 aa8.33□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms