RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000075430.11

CTDP1-201, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 3,538 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-201ENST00000075430 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa15.78■□□□□ 0.12
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CTDP1-201ENST00000075430 POLHQ9Y253 713 aa15.78■□□□□ 0.12
CTDP1-201ENST00000075430 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa15.78■□□□□ 0.12
CTDP1-201ENST00000075430 PSMD9O00233 223 aa15.78■□□□□ 0.12
CTDP1-201ENST00000075430 CXCL14O95715 111 aa15.78■□□□□ 0.12
CTDP1-201ENST00000075430 C8AP07357 584 aa15.78■□□□□ 0.12
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CTDP1-201ENST00000075430 SMPDL3AQ92484 453 aa15.76■□□□□ 0.11
CTDP1-201ENST00000075430 TCEAL4Q96EI5 215 aa15.76■□□□□ 0.11
CTDP1-201ENST00000075430 TMEM43Q9BTV4 400 aa15.76■□□□□ 0.11
CTDP1-201ENST00000075430 FAIM2Q9BWQ8 316 aa15.76■□□□□ 0.11
CTDP1-201ENST00000075430 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
CTDP1-201ENST00000075430 A0A087WUU8 490 aa15.75■□□□□ 0.11
CTDP1-201ENST00000075430 POP7O75817 140 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
CTDP1-201ENST00000075430 SLC22A5O76082 557 aa15.75■□□□□ 0.11
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