RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637100.1

CLN3-255, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLN3, Length 1,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-255ENST00000637100 NT5EP21589 574 aa14.9□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 MAGEA12P43365 314 aa14.9□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 HMGCS1Q01581 520 aa14.9□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 DUSP2Q05923 314 aa14.9□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 FBXW10Q5XX13 1052 aa14.9□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 PLCZ1Q86YW0 608 aa14.9□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 ZNF675Q8TD23 568 aa14.9□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 ERP27Q96DN0 273 aa14.9□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 MARK4Q96L34 752 aa14.9□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 CDK15Q96Q40 435 aa14.9□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 PACSIN3Q9UKS6 424 aa14.9□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 ZANQ9Y493 2812 aa14.89□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 JMJD1CQ15652 2540 aa14.89□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 A0A096LPK6 155 aa14.89□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 PRAMEF25A6NGN4 478 aa14.89□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 FRG2CA6NGY1 282 aa14.89□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 GOLGA6L10A6NI86 522 aa14.89□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 PLOD2O00469 737 aa14.89□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 ARHGEF9O43307 516 aa14.89□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 CTIFO43310 598 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 ZIC3O60481 467 aa14.89□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 TSPAN2O60636 221 aa14.89□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 ABCB7O75027 752 aa14.89□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 GUCY1B2O75343 617 aa14.89□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 GCKP35557 465 aa14.89□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 MC3RP41968 323 aa14.89□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 GAS1P54826 345 aa14.89□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 PLTPP55058 493 aa14.89□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 TOMM20Q15388 145 aa14.89□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 TRADDQ15628 312 aa14.89□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa14.89□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 MROH9Q5TGP6 573 aa14.89□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 CLEC9AQ6UXN8 241 aa14.89□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 COMMD6Q7Z4G1 85 aa14.89□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 LUZP2Q86TE4 346 aa14.89□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 IGFBPL1Q8WX77 278 aa14.89□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 BTBD9Q96Q07 612 aa14.89□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 FUT8Q9BYC5 575 aa14.89□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 BRF2Q9HAW0 419 aa14.89□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 PRM3Q9NNZ6 103 aa14.89□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 NDRG3Q9UGV2 375 aa14.89□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 TMCO1Q9UM00 188 aa14.89□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 PLLPQ9Y342 182 aa14.89□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 A0A1W2PNV4 684 aa14.88□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 C2orf72A6NCS6 295 aa14.88□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 LY6G6DO95868 133 aa14.88□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 TGM6O95932 706 aa14.88□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 CT45A8P0DMV1 189 aa14.88□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 CT45A9P0DMV2 189 aa14.88□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 MAPK12P53778 367 aa14.88□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 DIO3P55073 304 aa14.88□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 B3GALT5-AS1P59052 145 aa14.88□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 PSPHP78330 225 aa14.88□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 PLCXD2Q0VAA5 305 aa14.88□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 CT45A2Q5DJT8 189 aa14.88□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 C6orf163Q5TEZ5 329 aa14.88□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 IFNEQ86WN2 208 aa14.88□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 PIGTQ969N2 578 aa14.88□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 STARD4Q96DR4 205 aa14.88□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 COL21A1Q96P44 957 aa14.88□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa14.88□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 TAS2R10Q9NYW0 307 aa14.88□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 PRODH2Q9UF12 536 aa14.88□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 PSME2Q9UL46 239 aa14.88□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 MAPRE3Q9UPY8 281 aa14.88□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 H0Y3Z8 333 aa14.87□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 CASKO14936 926 aa14.87□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 CGAP01215 116 aa14.87□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 RBP1P09455 135 aa14.87□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 CNTFP26441 200 aa14.87□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 LOXP28300 417 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 TYK2P29597 1187 aa14.87□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 FEN1P39748 380 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 STARP49675 285 aa14.87□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 CCNG1P51959 295 aa14.87□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 CLDN15P56746 228 aa14.87□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 POU4F3Q15319 338 aa14.87□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 NNATQ16517 81 aa14.87□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 ZNF628Q5EBL2 1059 aa14.87□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 KLC3Q6P597 504 aa14.87□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 AAGABQ6PD74 315 aa14.87□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 Q71RC1 249 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 TMEM151AQ8N4L1 468 aa14.87□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 OR52R1Q8NGF1 315 aa14.87□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 OR14L1PQ8NHC6 308 aa14.87□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 ZNF592Q92610 1267 aa14.87□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 TMCO6Q96DC7 493 aa14.87□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 VSTM2LQ96N03 204 aa14.87□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa14.87□□□□□ -0.03
CLN3-255ENST00000637100 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms