RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 TPT1P8Q9HAU6 139 aa7.9□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 FOLH1BQ9HBA9 442 aa7.9□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 GPATCH2Q9NW75 528 aa7.9□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 NTMQ9P121 344 aa7.9□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 CFL2Q9Y281 166 aa7.9□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 DTX4Q9Y2E6 619 aa7.9□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 A6NL46 340 aa7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 EVPLLA8MZ36 301 aa7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 B2RBV5 119 aa7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 K7ENP7 123 aa7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 FXYD1O00168 92 aa7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 CLIC1O00299 241 aa7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 EBAG9O00559 213 aa7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 UNC5CO95185 931 aa7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 NPPAP01160 153 aa7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 KRT16P08779 473 aa7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 ALOX5P09917 674 aa7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 T-ENOLP0DO92 83 aa7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 ACP2P11117 423 aa7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 MATN1P21941 496 aa7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 PPIBP23284 216 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 CRATP43155 626 aa7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 KHKP50053 298 aa7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 CORO7P57737 925 aa7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 MTPNP58546 118 aa7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 SLC25A3Q00325 362 aa7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 VAC14Q08AM6 782 aa7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 RAPSNQ13702 412 aa7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 SELPLGQ14242 412 aa7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 MYBPC3Q14896 1274 aa7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 TUSC1Q2TAM9 212 aa7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 RUNDC3AQ59EK9 446 aa7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 FCRLBQ6BAA4 426 aa7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 LIAT1Q6ZQX7 453 aa7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 RINLQ6ZS11 566 aa7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 GALNT16Q8N428 558 aa7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 SIRT6Q8N6T7 355 aa7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 CDRT4Q8N9R6 151 aa7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 OR5D16Q8NGK9 328 aa7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 OR5L2Q8NGL0 311 aa7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 OR8K3Q8NH51 312 aa7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 FBXO27Q8NI29 283 aa7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 VSTM2LQ96N03 204 aa7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 ANKRD27Q96NW4 1050 aa7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 ACTRT3Q9BYD9 372 aa7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 LHPPQ9H008 270 aa7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 OR51I1Q9H343 314 aa7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 RAD21L1Q9H4I0 556 aa7.89□□□□□ -1.15
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SGMS1-211ENST00000626236 IKZF5Q9H5V7 419 aa7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 EPS8L2Q9H6S3 715 aa7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 CORO2BQ9UQ03 480 aa7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 KCNMB2Q9Y691 235 aa7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 EXPH5Q8NEV8 1989 aa7.89□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM200CA6NKL6 621 aa7.88□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 WWP2O00308 870 aa7.88□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 DNAJB5O75953 348 aa7.88□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 ETFAP13804 333 aa7.88□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 SLC6A2P23975 617 aa7.88□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 CCL11P51671 97 aa7.88□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 PSME3P61289 254 aa7.88□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 DCAF7P61962 342 aa7.88□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 FOXK2Q01167 660 aa7.88□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 BNIP1Q12981 228 aa7.88□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 RABL3Q5HYI8 236 aa7.88□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 COX20Q5RI15 118 aa7.88□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 NANOGP8Q6NSW7 305 aa7.88□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 TCTN3Q6NUS6 607 aa7.88□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 CDC73Q6P1J9 531 aa7.88□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa7.88□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 C16orf89Q6UX73 402 aa7.88□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 NPSR1Q6W5P4 371 aa7.88□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 HACD2Q6Y1H2 254 aa7.88□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 SLC5A8Q8N695 610 aa7.88□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 HORMAD2Q8N7B1 307 aa7.88□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 COX18Q8N8Q8 333 aa7.88□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF441Q8N8Z8 693 aa7.88□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 SLC16A11Q8NCK7 471 aa7.88□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 OR8J3Q8NGG0 315 aa7.88□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 OR52N2Q8NGI0 321 aa7.88□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 NUBPLQ8TB37 319 aa7.88□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 GPR151Q8TDV0 419 aa7.88□□□□□ -1.15
SGMS1-211ENST00000626236 ADAMTS15Q8TE58 950 aa7.88□□□□□ -1.15
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