RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601392.5

CELF4-222, Transcript of CUGBP Elav-like family member 4, human

TSL 1 (best)

Gene CELF4, Length 989 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CELF4-222	ENST00000601392	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		11.89	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		11.89	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	OR5AK3P	Q8NH89	298 aa		11.89	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		11.89	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	PTPMT1	Q8WUK0	201 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		11.89	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	JADE3	Q92613	823 aa		11.89	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	KAT2A	Q92830	837 aa		11.89	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	PMM1	Q92871	262 aa		11.89	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	PPWD1	Q96BP3	646 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	STAC	Q99469	402 aa		11.89	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	GPR87	Q9BY21	358 aa		11.89	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	RBCK1	Q9BYM8	510 aa		11.89	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		11.89	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		11.89	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	LIPT1	Q9Y234	373 aa		11.89	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	CFL2	Q9Y281	166 aa		11.89	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	PADI2	Q9Y2J8	665 aa		11.89	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		11.89	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	ATM	Q13315	3056 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	SPTA1	P02549	2419 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	TLN1	Q9Y490	2541 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	AQP12B	A6NM10	295 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	C1QL1	O75973	258 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	CBX7	O95931	251 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	IFNA16	P05015	189 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	CT62	P0C5K7	136 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	FAM87A	P0C7U9	286 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	TNNI3	P19429	210 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	GGT1	P19440	569 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	MYBPC3	Q14896	1274 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	TBR1	Q16650	682 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	11.88	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	PRAMEF7	Q5VXH5	474 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	GLYAT	Q6IB77	296 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	LCN8	Q6JVE9	175 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	CDC73	Q6P1J9	531 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	BORA	Q6PGQ7	559 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	CCDC80	Q76M96	950 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	PACS2	Q86VP3	889 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	IFNE	Q86WN2	208 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	DHFR2	Q86XF0	187 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	RNF130	Q86XS8	419 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	PTOV1	Q86YD1	416 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF843	Q8N446	348 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	RNF148	Q8N7C7	305 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	FBXL20	Q96IG2	436 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	TRIM15	Q9C019	465 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	PIGU	Q9H490	435 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	PRODH2	Q9UF12	536 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	C3orf18	Q9UK00	162 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	FARSA	Q9Y285	508 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	CLCA3P	Q9Y6N3	262 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	SCN3A	Q9NY46	2000 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	TMEM247	A6NEH6	219 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	OR2W5	A6NFC9	320 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	OR6C76	A6NM76	312 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	C17orf105	B2RV13	164 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	HMGN4	O00479	90 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	PRAMEF2	O60811	474 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	FKBP6	O75344	327 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	AK1	P00568	194 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	IGKV3-11	P04433	115 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	TFPT	P0C1Z6	253 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	ARAF	P10398	606 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	UMPS	P11172	480 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	SFTPC	P11686	197 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	ETFA	P13804	333 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	TCN2	P20062	427 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	PCGF2	P35227	344 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	KHK	P50053	298 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	EMD	P50402	254 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	GPR143	P51810	404 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	EFNA3	P52797	238 aa		11.87	□□□□□ -0.51

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